| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 863,092 | 2 bp→A | intergenic (‑11894/‑60624) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 863,092 | 0 | G | . | 100.0% | 65.6 / NA | 16 | intergenic (‑11894/‑60625) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (8/8); total (8/8) | |||||||||||
| * | 1 | 863,093 | 0 | T | A | 100.0% | 52.0 / NA | 16 | intergenic (‑11895/‑60624) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (8/8); total (8/8) | |||||||||||
GATTAACACGGCAACAGCAATAGCGATCAAACCATATTCAATTGCAGTCACACCTGCTTGATTTTCTCTGAAAGAACGGATTGCTTCAGCTGCTTTGATGTATGCTTTAGTAGTTAAAGTATTTAACATTGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGTGTTATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACTATGTATATGTACGTATTGTGATTGCGAAAACTTTTTAATTAACAGTATGTTAAGGGTTATTGTAAATGAGCTATTTCTACTTTCTCTATTGATTTTACAGTAAATTTACAACTTTTAACTTTAATTACAAAAACACTTAAATATGTGTGGATTTAGAGATATCGCG > 1/862855‑863310 | gATTAACACGGCAACAGCAATAGCGATCAAACCATATTCAATTGCAGTCACACCTGCTTGATTTTCTCTGAAAGAACGGATTGCTTCAGCTGCTTTGATGTATGCTTTAGTAGTTAAAGTATTTAACATTGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGaaa > 1:625438/1‑251 (MQ=255) tCACACCTGCTTGATTTTCTCTGAAAGAACGGATTGCTTCAGCTGCTTTGATGTATGCTTTAGTAGTTAAAGTATTTAACATTGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACtatgtatatg < 1:110562/251‑1 (MQ=255) gCTTCAGCTGCTTTGATGTATGCTTTAGTAGTTAAAGTATTTAACATTGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGaaa > 1:424453/1‑169 (MQ=255) tGCTTTAGTAGTTAAAGTATTTAACATTGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACTATGTATATGTACGTATTGTGATTGCGAAAACTTTTTAATTAACAGTATGTTAAGGGTTATTGTa < 1:484344/251‑1 (MQ=255) gTATTTAACATTGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACtatgtatatgta < 1:382401/182‑1 (MQ=255) ttGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGaat > 1:568183/1‑149 (MQ=255) gTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACtatgtatatg < 1:566836/168‑1 (MQ=255) gTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACTATGTATATGTACGTATTGTGATTGCGAAAACTTTTTAATTAACAGTATGtt < 1:199993/210‑1 (MQ=255) gTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACTATGTATATGTACGTATTGTGATTGCGAAAACTTTTTAATTAACAGTATGTTAAGGGTTATTGTAAATGAGCTATTTCTACTTTCTCTATTGa > 1:225005/1‑251 (MQ=255) cTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACTATGTATATGTACGTATTGTGATTGCGAAAACTTTTTAATTAACAGTATGTTAAggg > 1:497732/1‑213 (MQ=255) gtgtCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACtatgtatatg > 1:693226/1‑106 (MQ=255) gtgtCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACtatgtata < 1:666090/104‑1 (MQ=255) tttaATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGaaa < 1:498269/49‑1 (MQ=255) taataaGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACTATGTATATGTACGTATTGTGATTGCGAAAACTTTTTAATTAACAGTATGTTAAGGGTTATTGTAAATGAGCTATTTCTACTTTCTCTATTGATTTTACAGTAAATTTACAACTTTTAACTTTAATTACAAAAACACTTAAATATGTGTGGATTTAGAGATATcgcg > 1:354355/1‑251 (MQ=255) cTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACTATGTATATGTACGTATTGTGATTGCGAAAACTTTTTAATTAACAGTATGTTAAGGGTTATTg > 1:151415/1‑140 (MQ=255) tgtgGAATTAAATAAACGACCGGT‑ATATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACtatgtatatg < 1:744965/85‑1 (MQ=255) | GATTAACACGGCAACAGCAATAGCGATCAAACCATATTCAATTGCAGTCACACCTGCTTGATTTTCTCTGAAAGAACGGATTGCTTCAGCTGCTTTGATGTATGCTTTAGTAGTTAAAGTATTTAACATTGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGTGTTATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACTATGTATATGTACGTATTGTGATTGCGAAAACTTTTTAATTAACAGTATGTTAAGGGTTATTGTAAATGAGCTATTTCTACTTTCTCTATTGATTTTACAGTAAATTTACAACTTTTAACTTTAATTACAAAAACACTTAAATATGTGTGGATTTAGAGATATCGCG > 1/862855‑863310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |