| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 779,307 | 2 bp→TA | intergenic (+44434/+42525) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 779,307 | 0 | C | T | 100.0% | 84.4 / NA | 26 | intergenic (+44434/+42526) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (13/13); total (13/13) | |||||||||||
| * | 1 | 779,308 | 0 | G | A | 100.0% | 84.4 / NA | 26 | intergenic (+44435/+42525) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (13/13); total (13/13) | |||||||||||
TAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAGCGAAAAGAAACTTCCCTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAACGAGCTTTTTCTAAAAGCTGTTGTTCCGCTTCTTCCATCCAAACTACGGTGTAATCCAATTTCATTTTAAGCCCAATACTTTTTCCAGGTTAGCTAATACTTCTTCATTGGATTTGACTTTAATTTCTCCGTTATCTAGCCGTGCAAAAAATAACGCTTCTTCGGAAAGCGTCACTTTTTGTGGTAGGTAGTCATCTTTACGATAGTTATTC‑TGTGTATTTAAGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAACATAAATATGCTAATAAGATTAAACACATAAAAATAAATATGTTTTTATGTG > 1/779069‑779500 || tAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGaa < 1:726771/251‑1 (MQ=255) ggATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAg > 1:413180/1‑251 (MQ=255) ggATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAg > 1:715473/1‑251 (MQ=255) tttGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACtt < 1:699369/251‑1 (MQ=255) tAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGGCTTTGCGGTAG‑GATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATc < 1:277438/251‑1 (MQ=255) 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TAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAGCGAAAAGAAACTTCCCTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAACGAGCTTTTTCTAAAAGCTGTTGTTCCGCTTCTTCCATCCAAACTACGGTGTAATCCAATTTCATTTTAAGCCCAATACTTTTTCCAGGTTAGCTAATACTTCTTCATTGGATTTGACTTTAATTTCTCCGTTATCTAGCCGTGCAAAAAATAACGCTTCTTCGGAAAGCGTCACTTTTTGTGGTAGGTAGTCATCTTTACGATAGTTATTC‑TGTGTATTTAAGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAACATAAATATGCTAATAAGATTAAACACATAAAAATAAATATGTTTTTATGTG > 1/779069‑779500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |