| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 778,787 | 2 bp→TA | intergenic (+43914/+43045) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 778,787 | 0 | A | T | 100.0% | 42.1 / NA | 14 | intergenic (+43914/+43046) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (10/4); total (10/4) | |||||||||||
| * | 1 | 778,788 | 0 | G | A | 100.0% | 40.9 / NA | 14 | intergenic (+43915/+43045) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (10/4); total (10/4) | |||||||||||
ACCGGTGATACCAAAACCGCCTGTGAAGCTCTACTCTGCTTATCATCACCAAAAGACGCGGCGAAAACGCCGGAATGTCATCCGCCGTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAACTTTTTAAAACTATGCCCGGATGCTAGTGATGATTCAGTGAACCAGGCTTTATCTACAAAATGCGCCCGCAAGCCGTTCAGTCGAAAATGTATATTTAAATAAAAACATAAACACATATAAAAATAAAAGCATAAATTGATATTTATGCTTTTATTG‑TTTTTGAGGTGATATAAAGCAACGGCTATATTACAAATTCACGCCCTTTTGCCA > 1/778602‑778961 || cccGGTGATAAGAAAACCGCTTGTGAAGCTCTACTCTGCTTATCATCACCAAAAGACGCGGCGAAAACGCCGGAATGTCATCCGCCGTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTtaaata < 1:589770/250‑1 (MQ=255) ttgtgAAGCTCTACTCTGCTTATCATCACCAAAAGACGCGGCGAAAACGCCGGAATGTCATCCGCCGTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATaaatatacttaag < 1:62019/250‑11 (MQ=255) gCTTATCATCACCAAAAGACGCGGCGAAAACGCCGGAATGTCATCCGCCGTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATaaatat > 1:659119/1‑224 (MQ=255) atcatcACAAAAAGACGCGGCAAAAACGCCGGAATGTCATCCGCCGTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATAAATATACTTAAGAATAAAAGCATAAAtatttat < 1:856024/251‑7 (MQ=255) cGCCGGAATGTCATCCGCCGTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATaaat > 1:537831/1‑194 (MQ=255) ccGGAATGTCATCCGCCGTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAGAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACAt > 1:489645/1‑189 (MQ=255) gTCATCCGCCGTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATaaatatac > 1:668120/1‑185 (MQ=255) aTCCGCCGTTAAATAAGGTCTATTCAAATCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATAAATATACTTAAGAATAAAAGCATAAATATTTATTTATACTTTTATTGTTTTTTGAGGTGATATAACGCacc < 1:357263/251‑3 (MQ=255) ccgccgTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATAAATATACTTAAGAATAAAAGCATAAAtatttatttatac > 1:573286/1‑205 (MQ=255) ccgTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATaaatatacttaagaataaaag > 1:106465/1‑177 (MQ=255) aaTAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATAAATATACTTAAGAATAAAAGCATAAATATTTATTTATACTTTTATTGTTTTTTGAGGTGATATAACGCACCGGCTATATTa > 1:603365/1‑250 (MQ=255) aTAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATAAATATACTTAAGAATAAAAGCATAAATATTTATTTATACTTTTATTGTTTTTTGAGGTGATATaa > 1:344237/1‑233 (MQ=255) aTTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATAAATATACTTAAGAATAAAAGCATAAATATTTATTTATACTTTTATTGTTTTTTGAGGTGATATAACGCACCGGCTATATTACAAATTcccg > 1:724935/1‑247 (MQ=255) ggCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAATTTTTTAAAATTGTGTCCAAATTCTAACGAGGACTCTATTAATCAAGCATTATCGAGCAAATGCGCCCGCAAGCCGTTTAGTCGAAGATGTATGTTTAAATAAAAACATAAATATACTTAAGAATAAAAGCATAAATATTTATTTATACTTTTATTGTTTTTTGAGGTGATATAACGCACCGGCTATATTACAAATTCCCGCCCTTTTGcta > 1:17085/1‑249 (MQ=255) || ACCGGTGATACCAAAACCGCCTGTGAAGCTCTACTCTGCTTATCATCACCAAAAGACGCGGCGAAAACGCCGGAATGTCATCCGCCGTTAAATAAGTTCTATTCAATTCGGGCTAAAAAACCACACGAAACATTAAAGAAACGTCGTAACTTTTTAAAACTATGCCCGGATGCTAGTGATGATTCAGTGAACCAGGCTTTATCTACAAAATGCGCCCGCAAGCCGTTCAGTCGAAAATGTATATTTAAATAAAAACATAAACACATATAAAAATAAAAGCATAAATTGATATTTATGCTTTTATTG‑TTTTTGAGGTGATATAAAGCAACGGCTATATTACAAATTCACGCCCTTTTGCCA > 1/778602‑778961 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |