| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 777,898 | 2 bp→TA | intergenic (+43025/+43934) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 777,898 | 0 | A | T | 100.0% | 81.6 / NA | 25 | intergenic (+43025/+43935) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (15/10); total (15/10) | |||||||||||
| * | 1 | 777,899 | 0 | C | A | 100.0% | 83.0 / NA | 25 | intergenic (+43026/+43934) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (15/10); total (15/10) | |||||||||||
ATTCTATATGCCCCCGACAATCAGGAGGACGCGGAAGAATATTCTAAGGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCACAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATCACCGACCATGGGCGACCGTTGCTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGTAAGCCAATACTGTGTAATAAAGCGGTTTACTATAACGACCCTTATTTTATTGACAAATTGAAAGCGGTTTCCCCGCAATTACGCGCACTAGGCAAGAAATTACCGACTAAAGCGCAACTGGAAAAAGCCATGTTCAGTGGTGAGCTCTCCGCCCAATCCATTTAAGTCAGTTCTATATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAATATGAAAAAATTTTTACTTATGAATACGTTAATCTC > 1/777692‑778134 || aTTCTATATGCACCCGACAACCAGGAGGACGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCttattttataga > 1:420535/1‑248 (MQ=255) atTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCttattttat > 1:659792/1‑208 (MQ=255) 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1:114465/158‑1 (MQ=255) caGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCttatttt > 1:705914/1‑139 (MQ=255) gTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAAtt > 1:504881/1‑251 (MQ=255) ttaCCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAggt > 1:285462/3‑178 (MQ=255) cGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAATTTaatccacaaaaactg < 1:47410/250‑14 (MQ=255) 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tgATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAATTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAATATGAAAAAAATTTTACTTATGAATATGTTAAtacc < 1:434082/250‑4 (MQ=255) tgATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAATTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAATATGAAAAAAATTTTACTTATGAATATGTTAAtacc < 1:403990/250‑4 (MQ=255) || ATTCTATATGCCCCCGACAATCAGGAGGACGCGGAAGAATATTCTAAGGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCACAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATCACCGACCATGGGCGACCGTTGCTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGTAAGCCAATACTGTGTAATAAAGCGGTTTACTATAACGACCCTTATTTTATTGACAAATTGAAAGCGGTTTCCCCGCAATTACGCGCACTAGGCAAGAAATTACCGACTAAAGCGCAACTGGAAAAAGCCATGTTCAGTGGTGAGCTCTCCGCCCAATCCATTTAAGTCAGTTCTATATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAATATGAAAAAATTTTTACTTATGAATACGTTAATCTC > 1/777692‑778134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |