| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 493,704 | T→C | intergenic (+2789/‑203004) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 493,704 | 0 | T | C | 100.0% | 233.1 / NA | 69 | intergenic (+2789/‑203004) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (30/39); total (30/39) | |||||||||||
TGGTGGCGCTTTTCTCCGCACCCAACAAATTGCGTTGCGCCCGATGCCAATCAATTAAAATTTTCACTTCCAGTTCCGGTTTATCCTGCTTCGCACAATAAATTTCATCCAGAATTTCTTGTCCCGCCTCGTCATTTTGCCAATAAAGTGCGGTCACAATAATCCGCGTTTTTGCTTGTCGAGTCAGCTGAATAATTTCGCTTTTAAAGGCAGCCGGGCTATAAATAAATTCCACTTGTTCCGGCTGTAATGGCAAACATGGCAGGCTTTCAAGACGTTTGCGCGCACGTTCGATTTTATCTGTAAACATAAATTAGTTCTCTATAAAAACGCTGTGAGTAAGAATGTAAATGAATTTTAATTAGCGCCGTAGTTTACAATATTTATCGCCCACCTTGGTAGAAAAAAGGTTTTTTTTCGTTATAATGCTCACACTTTTACACTAAAAATGAGCAAAATCCGTTCATTTTATCGCTATCCATATC > 1/493466‑493950 | tggtggCGCTTTTCTCCGCACCCAACAAATTGCGTTGCGCCCGATGCCAATCAATTAAAATTTTCACTTCCAGTTCCGGTTTATCCTGCTTCGCACAATAAATTTCATCCAGAATTTCTTGTCCCGCCTCGTCATTTTGCCAATAAAGTGCGGTCACAATAATCCGCGTTTTTGCTTGTCGAGTCAGCTGAATAATTTCGCTTTTAAAGGCAGCCGGGCTATAAATAAATTCCACTTGCTCCGGCTGTAAt < 1:309393/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ataaataaATTCCACTTGCTCCGGCTGTAATGGCAAACATGGCAGGCTTTCAAGACGTTTGCGCGCACGTTCGATTTTATCTGTAAACATAAATTAGTTCTCTATAAAAACGCTGTGAGTAAGAATGTAAATGAATTTTAATTAGCGCCGTAGTTTACAATATTTATCGCCCACCTTGGTAGAAAAAAGGTTTTTTTTCGTTATAATGCTCACACTTTTACACTAAAAATGAGCAAAATCCGTTCATTTTa > 1:763156/1‑251 (MQ=255) ccACTTGCTCCGGCTGTAATGGCAAACATGGCAGGCTTTCAAGACGTTTGCGCGCACGTTCGATTTTATCTGTAAACATAAATTAGTTCTCTATAAAAACGc < 1:853533/102‑1 (MQ=255) cACTTGCTCCGGCTGTAATGGCAAACATGGCAGGCTTTCAAGACGTTTGCGCGCACGTTCGATTTTATCTGTAAACATAAATTAGTTCTCTATAAAAACGCTGTGAGTAAGAATGTAAATGAATTTTAATTAGCGCCGTAGTTTACAATATTTATCGCCCACCTTGGTAGAAAAAAGGTTTTTTTTCGTTATAATGCTCACACTTTTACACTAAAAATGAGc < 1:859503/222‑1 (MQ=255) cTTGCTCCGGCTGTAATGGCAAACATGGCAGGCTTTCAAGACGTTTGCGCGCACGTTCGATTTTATCTGTAAACATAAATTAGTTCTCTATAAAAACGCTGTGAGTAAGAATGTAAATGAATTTTAATTAGCGCCGTAGTTTACAATATTTATCGCCCACCTTGGTAGAAAAAAGGTTTTTTTTCGTTATAATGCTCACACTTTTACACTAAAAATGAGCAAAATCCGTTCATTTTATCGCTATCCATATc < 1:878733/251‑1 (MQ=255) | TGGTGGCGCTTTTCTCCGCACCCAACAAATTGCGTTGCGCCCGATGCCAATCAATTAAAATTTTCACTTCCAGTTCCGGTTTATCCTGCTTCGCACAATAAATTTCATCCAGAATTTCTTGTCCCGCCTCGTCATTTTGCCAATAAAGTGCGGTCACAATAATCCGCGTTTTTGCTTGTCGAGTCAGCTGAATAATTTCGCTTTTAAAGGCAGCCGGGCTATAAATAAATTCCACTTGTTCCGGCTGTAATGGCAAACATGGCAGGCTTTCAAGACGTTTGCGCGCACGTTCGATTTTATCTGTAAACATAAATTAGTTCTCTATAAAAACGCTGTGAGTAAGAATGTAAATGAATTTTAATTAGCGCCGTAGTTTACAATATTTATCGCCCACCTTGGTAGAAAAAAGGTTTTTTTTCGTTATAATGCTCACACTTTTACACTAAAAATGAGCAAAATCCGTTCATTTTATCGCTATCCATATC > 1/493466‑493950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |