| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 468,967 | T→C | intergenic (‑54668/‑21858) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 468,967 | 0 | T | C | 100.0% | 357.5 / NA | 103 | intergenic (‑54668/‑21858) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (47/56); total (47/56) | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
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ttCTACTCCTAATCCGCCTATGGCAGCCCCGCTTTCAACTATTCCCGCGAAGAACATAAGCTCAACCTTGCCGAACTTTTAAACCCCCTTTCAGACGACCTGGAAAACACCGTCCTGAAAGACAACAACCTGTCCGTCATCAAACATACCCCCAAATTTATCAGCAACAAATCCCCCGACACGCCTACCAACCGAATCCTGACCTCGCTGCTGTGCCGCGACCGCCTCGCCTTTCTCCTGCAATACGGCtt < 1:174301/251‑1 (MQ=255) cTACTCCTCATCCGCCTATGGCAGCCCCGCTTTCAACTATTTCCGCGAAGAACATAAGCTCAACCTTGCCGAACTTTTAAACACCCTTTCAGACGACCTTGAAAACACCGTCCTGCAAGACAACAACCTGTCCGTCATCAAACATAACCCCGAATTTATCAGCAACAAATCCCCCGACACGCCTACCAACCGAATCCTGACCTCGCTGCTGTGCCGCGACCGCCTCGCCTTTCTCCTGCAATACGGCTTTg > 1:661391/1‑251 (MQ=255) cTACTCCTCATCCGCCTATGGCAGCCCCGCTTTCAACTATTTCCGCGAAGAACATAAGCTCAACCTTGCCGAACTTTTAAACACCCTTTCAGACGACCTTGAAAACACCGTCCTGCAAGACAACAACCTGTCCGTCATCAAACATAACCCCGAATTTATCAGCAACAAATCCCCCGACACGCCTACCAACCGAATCCTGACCTCGCTGCTGTGCCGCGACCGCCTCGCCTTTCTCCTGCAATACGGCTTTg > 1:414283/1‑251 (MQ=255) 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GCCCAATAACAAAGGCGGTATAGGCGCAGAACGCGAGCGGATGGCAAAGCGCGCGCAAAATCCCAAATTCCGCCGCTTTATCAACATCACCCAATTCATGATTTTTTCCAACAACATGGAATACGACGACGGCGCGACCGAGCCGGTGCAGGGCGCATTCTACTCCTCATCCGCCTATGGCAGCCCCGCTTTCAACTATTTCCGCGAAGAACATAAGCTCAACCTTGCCGAACTTTTAAACACTCTTTCAGACGACCTTGAAAACACCGTCCTGCAAGACAACAACCTGTCCGTCATCAAACATAACCCCGAATTTATCAGCAACAAATCCCCCGACACGCCTACCAACCGAATCCTGACCTCGCTGCTGTGCCGCGACCGCCTCGCCTTTCTCCTGCAATACGGCTTTGCATACGTCGAAACACAAAACGGCATAAAAAAACACATCATGCGCTATCCGCAGCTTTTCGCCGCCTACGCCACCG > 1/468724‑469208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |