| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 2,069,240 | T→C | intergenic (‑12205/+34756) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,069,240 | 0 | T | C | 100.0% | 226.3 / NA | 66 | intergenic (‑12205/+34756) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (23/43); total (23/43) | |||||||||||
TCAAAGCGTCTTCATCCGCCTGATTCACTAAAATCAAGCCTTTTTTACTAAACAAATAGCCCACGGAACCCTCGGTGCCTAAGTTACCGCCACATTTGGTAAAACTCGGGCGCACTTGGGAAATAGTGCGATTGGCGTTATCGCTTAAACATTCCACCATCACTGCCGCACCGCCCGGACCGTAACCTTCATACACGCGGGTTTCCATGTTGGTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGTACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTCACGAATTAATTTGGTAAAAATTTTCCCGCGCTGAGCATCTTGTGCCGCTTTACGGTGTTTAATATTTGCCCACTTACTATGGCCTGCCATTTTGTATTCCTTCTCAATTTATTTAAATTCGGCTTATTTC > 1/2068994‑2069484 | tCAAGGCGTCTTCATCCGCCGGATTCACTAAAATCAAGCCTTTTTTACTAAACAAATAGCCCACGGAACCCTCGGTGCCTAAGTTACCGCCACATTTGGTAAAACTCGGGCGCACTTGGGAAATAGTGCGATTGGCGTTATCGCTTAAACATTCCACCATCACTGCCGCACCGCCCGGACCGTAACCTTCATACACGCGGGTTTCCATGTTGGTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGCACgg < 1:854193/251‑1 (MQ=255) 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ccGTAACCTTCATACACGCGGGTTTCCATGTTGGTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGCACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTCACGAATTAATTTGGTAAAAATTTTCCCGCGCTGAGCATCTTGTGCCGCTTTACGGTGTTTAATATTTg > 1:559116/1‑250 (MQ=255) ccTTCATACACGCGGGTTTCCATGTTGGTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGCACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGAtt > 1:571076/1‑156 (MQ=255) cATACACGCGGGTTTCCATGTTGGTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGCACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTCACGAATTAATTTGGTAAAAATTTTCCCGCGCTGAGCATCTTGTGCCGCTTTACGGTGTTTAATATTTGCCCACTTACTa < 1:220621/251‑1 (MQ=255) ggTTTCCATGTTGGTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGCACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTc > 1:108690/1‑162 (MQ=255) ccATGTTGGTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGCACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTCACGAATTAATTTGGTAAAAATTTTCCCGCGCTGAGCATCTTGTGCCGCTTTACGGTGTTTAATATTTGCCCACTTACTATGGCCTGCCATTTTg > 1:265675/1‑251 (MQ=255) aTGTTGGTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGCACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTCACGAATTAAttt < 1:287233/167‑1 (MQ=255) tGGTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGCACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTCACGAATTAATTTGGTAAAAATTTTCCCGCGCTGAGCATCTTGTGCCGCTTTACGGTGTTTAATATTTGCCCACTTACTATGGCCTGCCATTTTGTATTcc < 1:681586/251‑1 (MQ=255) gTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGCACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTCACGAATTAATTTGGTAAAAATTTTCCCGCGCTGAGCAt < 1:126089/187‑1 (MQ=255) cgccgACGCCGCGCTCAATCGCACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTCACGAATTAATTTGGTAAAAATTTTCCCGCGCTGAGCATCTTGTGCCGCTTTACGGTGTTTAATATTTGCCCACTTACTATGGCCTGCCATTTTGTATTCCTTCTCAAtttattta > 1:337359/1‑251 (MQ=255) cAATCGCACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTCACGAATTAATTTGGTAAAAATTTTCCCGCGCTGAGCATCTTGTGCCGCTTTACGGTGTTTAATATTTGCCCACTTACTATGGCCTGCCATTTTGTATTCCTTCTCAATTTATTTAAATTCGGCTTATTTc < 1:629516/251‑1 (MQ=255) | TCAAAGCGTCTTCATCCGCCTGATTCACTAAAATCAAGCCTTTTTTACTAAACAAATAGCCCACGGAACCCTCGGTGCCTAAGTTACCGCCACATTTGGTAAAACTCGGGCGCACTTGGGAAATAGTGCGATTGGCGTTATCGCTTAAACATTCCACCATCACTGCCGCACCGCCCGGACCGTAACCTTCATACACGCGGGTTTCCATGTTGGTATCATCGCCACCGCCGACGCCGCGCTCAATCGTACGGTTAATGGTATCACGGGTCATATTATTGCTTAATGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGAACTAACATCACCGCCACCGATTTTAGCGGCAGTCACCAATTCACGAATTAATTTGGTAAAAATTTTCCCGCGCTGAGCATCTTGTGCCGCTTTACGGTGTTTAATATTTGCCCACTTACTATGGCCTGCCATTTTGTATTCCTTCTCAATTTATTTAAATTCGGCTTATTTC > 1/2068994‑2069484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |