| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 368,019 | C→T | intergenic (‑21197/+44453) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Ser‑GCT/tRNA‑Ala‑TGC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 368,019 | 0 | C | T | 100.0% | 309.6 / NA | 90 | intergenic (‑21197/+44453) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/tRNA‑Ala‑TGC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (40/50); total (40/50) | |||||||||||
TTTGTAGATCCCGCATATTAATTTGTTGCGAATGAATTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACCATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTGAGTTTGCATTCAAAATCCCTGGTGGAAATTAACTATCAGTCTTTTGCTTCGCAGGA > 1/367778‑368263 | tttGTAGATCCCGCATATTAATTTGTTGCGAATGAATTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATtg < 1:622851/251‑1 (MQ=255)tttGTAGATCCCGCATATTAATTTGTTGCGAATGAATTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATtg < 1:598536/251‑1 (MQ=255) ccGCATATTAATTTGTTGCGAATGAATTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATtattat > 1:216434/1‑251 (MQ=255) cATATTAATTTGTTGCGAATGAATTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCt < 1:395919/250‑1 (MQ=255) aaTTTGTTGCGAATGAATTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCgg > 1:361594/1‑251 (MQ=255) aaTTTGTTGCGAATGAATTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCgg > 1:809835/1‑251 (MQ=255) ttgCGAATGAATTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGcatcat < 1:614982/251‑1 (MQ=255) gaatTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGatt < 1:828015/223‑1 (MQ=255) gaatTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCAt > 1:681227/1‑251 (MQ=255) gaatTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATGCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATc < 1:318577/229‑1 (MQ=255) aatTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCtt < 1:220384/213‑1 (MQ=255) aatTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCAtt > 1:49847/1‑251 (MQ=255) atTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATtg < 1:36707/216‑1 (MQ=255) atTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTa > 1:708799/1‑251 (MQ=255) atTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTa > 1:270399/1‑251 (MQ=255) atatCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTc < 1:547770/251‑1 (MQ=255) atatCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTc < 1:693890/251‑1 (MQ=255) tatCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTAt > 1:800384/1‑209 (MQ=255) cACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATc < 1:744791/219‑1 (MQ=255) cACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTgg > 1:636448/1‑250 (MQ=255) cTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGgcgc < 1:109021/251‑1 (MQ=255) cTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGgcgc < 1:2762/251‑1 (MQ=255) cTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGgcg > 1:738612/1‑250 (MQ=255) cTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGgcg > 1:365362/1‑250 (MQ=255) cAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGattat < 1:140642/210‑1 (MQ=255) tGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTAt > 1:785860/1‑197 (MQ=255) tGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATtg < 1:522715/199‑1 (MQ=255) tATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAATGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCggg < 1:435844/250‑1 (MQ=255) tATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATgg < 1:488312/246‑1 (MQ=255) aTTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCatcatc > 1:664832/1‑220 (MQ=255) gCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATc < 1:50371/181‑1 (MQ=255) cGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATcc < 1:91580/251‑1 (MQ=255) cGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATcc < 1:23660/251‑1 (MQ=255) cGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCACCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATcc < 1:65724/251‑1 (MQ=255) tCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGgcgc > 1:336533/1‑212 (MQ=255) gcgcAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAg > 1:895360/1‑251 (MQ=255) aTTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATc > 1:425779/1‑182 (MQ=255) gTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAATAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATc < 1:123192/178‑1 (MQ=255) aTCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTcc < 1:788127/249‑1 (MQ=255) tAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTg > 1:676277/1‑250 (MQ=255) aaGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCg < 1:49363/251‑1 (MQ=255) aaCGCAGGCATGAAAAGACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCGCTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCTCCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTattaatggcttccgcataggat < 1:528129/250‑22 (MQ=255) ggCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAg > 1:135831/1‑251 (MQ=255) gAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACg > 1:254073/1‑221 (MQ=255) aaaaaaCGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATcc > 1:319548/1‑201 (MQ=255) aaaaaaCGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCg < 1:610853/251‑1 (MQ=255) tGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATc < 1:509991/134‑1 (MQ=255) tGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGc < 1:422827/228‑1 (MQ=255) cGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATtg < 1:839502/115‑1 (MQ=255) ggTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGaa > 1:658327/1‑251 (MQ=255) gTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATCAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGaa > 1:455269/1‑250 (MQ=255) tAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATcc < 1:844216/174‑1 (MQ=255) tAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAAc < 1:879681/250‑1 (MQ=255) aaaaaCCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATAc < 1:137964/228‑1 (MQ=255) ccaccGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAAt < 1:533884/251‑1 (MQ=255) caccGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAAtg < 1:138718/251‑1 (MQ=255) cTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGaaa < 1:582627/251‑1 (MQ=255) cTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGaaa > 1:535964/1‑251 (MQ=255) ttGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATcc < 1:286032/155‑1 (MQ=255) tGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGcc < 1:336110/251‑1 (MQ=255) acacTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCaa > 1:312354/1‑143 (MQ=255) acacTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTgcg > 1:873949/1‑251 (MQ=255) acTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGcc < 1:657756/251‑1 (MQ=255) cTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCa > 1:464520/1‑251 (MQ=255) aaTGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGc < 1:653453/150‑1 (MQ=255) aaTGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAat > 1:567781/1‑251 (MQ=255) aaTGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAat > 1:891930/1‑251 (MQ=255) tGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAatat < 1:411333/251‑1 (MQ=255) tGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAatat < 1:814059/251‑1 (MQ=255) tGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAatat < 1:567556/251‑1 (MQ=255) tGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAatat < 1:26901/251‑1 (MQ=255) tGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAatat < 1:300919/251‑1 (MQ=255) cGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTc > 1:41330/1‑167 (MQ=255) gTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTg > 1:256872/1‑251 (MQ=255) ttttCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATc > 1:579540/1‑82 (MQ=255) ttttCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTg < 1:707017/250‑1 (MQ=255) cTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGaa < 1:338491/195‑1 (MQ=255) aCCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATtg < 1:664125/65‑1 (MQ=255) ggCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATcc < 1:627439/125‑1 (MQ=255) ggCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTGAg > 1:544150/1‑241 (MQ=255) gCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACg > 1:516191/1‑143 (MQ=255) tAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTGAGTTTGCATTCAAAATCCCTGGTGGAAATTa > 1:873298/1‑251 (MQ=255) aaaCATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTGAGTTTGCATTCAAAATCCCTGGTGGAAATTaa > 1:351934/1‑251 (MQ=255) ttCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAatat > 1:747438/1‑208 (MQ=255) aCCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTGAGTTTGCATTCAAAATCCCTGGTGGAAATTAACTATCAGTCTTTTGc < 1:671913/251‑1 (MQ=255) gCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGcc < 1:103242/189‑1 (MQ=255) gCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAatat > 1:165447/1‑189 (MQ=255) gCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTGAGTTTGCATTCAAAATCCCTGGTGGAAATTAACTATCAGTCTTTTGCTTCGCAGGa > 1:843449/1‑251 (MQ=255) gCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTGAGTTTGCATTCAAAATCCCTGGTGGAAATTAACTATCAGTCTTTTGCTTCGCAGGa > 1:360984/1‑251 (MQ=255) gCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTGAGTTTGCATTCAAAATCCCTGGTGGAAATTAACTATCAGTCTTTTGCTTCGCAGGa > 1:855043/1‑251 (MQ=255) | TTTGTAGATCCCGCATATTAATTTGTTGCGAATGAATTAATATCACTACAAATGAGTATTTTAGGCGGATTCCCAGCGCAATTTGTTTTAGATCAAATTTAAGAACGCAGGCATGAAAAAACGCCGCTTGATAAAACGCCGGTAAAAACCACCGCACTTTTTTGTTACACTAATGACACGTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACCATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTGAGTTTGCATTCAAAATCCCTGGTGGAAATTAACTATCAGTCTTTTGCTTCGCAGGA > 1/367778‑368263 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |