| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,712,279 | A→G | intergenic (+12646/+5896) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Ser‑GGA/tRNA‑Trp‑CCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,712,279 | 0 | A | G | 100.0% | 361.0 / NA | 102 | intergenic (+12646/+5896) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/tRNA‑Trp‑CCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (47/55); total (47/55) | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
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cTTATGATTCTCGTTCTGTTTTACTTCGTCTTTACCACGCTGTCGGGCTTTATCGCCGCGCCTTTTAATGGCTTGCTGGCGGAAAAAGTGGAAAAAATGCTGACCGGAGAAAATTTGCAGGATATGTCCCTGTGGGATTTTATGAAAGATGTGCCGCGGATGCTGGTACGGGAATGGCAAAAGCTGGTTTACAGCTTGCCAAAAATCATCGCGTTGTTTTTATTGGGATTTGTGCCTTTGCTGGGGCaaa > 1:648858/1‑250 (MQ=255) tATGATTCTCGTTCTGTTTTACTTCGTCTTTACCACGCTGTCGGGCTTTATCGCCGCGCCTTTTAATGGCTTGCTGGCGGAAAAAGTGGAAAAAATGCTGACCGGAGAAAATTTGCAGGATATGTCCCTGTGGGATTTTATGAAAGATGTGCCGCGGATGCTGGTACGGGAATGGCAAAAGCTGGTTTACAGCTTGCCAAAAATCATCGCGTTGTTTTTATTGGGATTTGTGCCTTTGCTGGGGCAAACCa > 1:865226/1‑251 (MQ=255) gTTTTACTTCGTCTTTACCACGCTGTCGGGCTTTATCGCCGCGCCTTTTAATGGCTTGCTGGCGGAAAAAGTGGAAAAAATGCTGACCGGAGAAAATTTGCAGGATATGTCCCTGTGGGATTTTATGAAAGATGTGCCGCGGATGCTGGTACGGGAATGGCAAAAGCTGGTTTACAGCTTGCCAAAAATCATCGCGTTGTTTTTATTGGGATTTGTGCCTTTGCTGGGGCAAACCATGATTCCCGTAGCGa > 1:472150/1‑251 (MQ=255) 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CTGCTTTCCATTCTTATGATTCTCGTTCTGTTTTACTTCGTCTTTACCACGCTGTCGGGCTTTATCGCCGCGCCTTTTAATGGCTTGCTGGCGGAAAAAGTGGAAAAAATGCTGACCGGAGAAAATTTGCAGGATATGTCCCTGTGGGATTTTATGAAAGATGTGCCGCGGATGCTGGTACGGGAATGGCAAAAGCTGGTTTACAGCTTGCCAAAAATCATCGCGTTGTTTTTATTGGGATTTATGCCTTTGCTGGGGCAAACCATGATTCCCGTAGCGACCTTTTTATTCACCGCATGGATGATGGCGATTCAATATTGCGACTATCCTTTTGATAACCACAAAATCCCTTTCGGCATAATGAAAAACGAACTGGCGATTAAGCGCAATGTGACGATGACCTTCGGCAGTTTGGTGACGCTTTGTACTTTTGTGCCGGTGGTGAATCTGGTGATTATTCCCGTGGCAGTGTGTGGCGCAACGGCAATG > 1/1712036‑1712524 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |