| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,693,043 | G→A | intergenic (‑66918/‑6501) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Ser‑GGA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,693,043 | 0 | G | A | 100.0% | 216.3 / NA | 64 | intergenic (‑66918/‑6501) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Ser‑GGA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (28/36); total (28/36) | |||||||||||
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gTATCCACAAGTGACAAATATTATTCGTGATGCAATTGAACTACGTTATGTATTAATGCCTTATTTATACAATACACTTTGGAAAGCACATCAAGATAACGAACCTATATTGCGTCCAACTTTCCTTGATCATGAACATGATAAAAACACATTTGCAGAAAATGATGATTATCTTCTTGGTGAAGATTTATTAGTCGCATCTGTGGTAGAACCAAATCAAAGAGTACGGGATGTTTATCTTCCACAAAAtt > 1:231351/1‑251 (MQ=255) aTCCACAAGTGACAAATATTATTCGTGATGCAATTGAACTACGTTATGTATTAATGCCTTATTTATACAATACACTTTGGAAAGCACATCAAGATAACGAACCTATATTGCGTCCAACTTTCCTTGATCATGAACATGATAAAAACACATTTGCAGAAAATGATGATTATCTTCTTGGTGAAGATTTATTAGTCGCATCTGTGGTAGAACCAAATCAAAGAGTACGGGATGTTTATCTTc > 1:118290/1‑240 (MQ=255) aGTGACAAATATTATTCGTGATGCAATTGAACTACGTTATGTATTAATGCCTTATTTATACAATACACTTTGGAAAGCACATCAAGATAACGAACCTATATTGCGTCCAACTTTCCTTGATCATGAACATGATAAAAACACATTTGCAGAAAATGATGATTATCTTCTTGGTGAAGATTTATTAGTCGCATCTGTGGTAGAACCAAATc < 1:228728/209‑1 (MQ=255) | ACTTGGTCTGGTGATAACCGTACAAGCTGGAATACATTACGCTATAACATCAAAATGGGATTAGGGATGAGTCTCTCAGCCCTTTATAACGTCGGTCATGATGTTGGTGGTTTTTCAGGCGAGAAGCCAGATCCGGAGTTATTTGTCCGCTGGGTTCAAAATGGCGTGATGCACCCACGTTTTACCATTCACTCTTGGAATGATGACAAAACCGTCAACGAACCTTGGATGTATCCACAAGTGGCAAATATTATTCGTGATGCAATTGAACTACGTTATGTATTAATGCCTTATTTATACAATACACTTTGGAAAGCACATCAAGATAACGAACCTATATTGCGTCCAACTTTCCTTGATCATGAACATGATAAAAACACATTTGCAGAAAATGATGATTATCTTCTTGGTGAAGATTTATTAGTCGCATCTGTGGTAGAACCAAATCAAAGAGTACGGGATGTTTATCTTCCACAAAATT > 1/1692800‑1693280 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |