| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,643,279 | A→G | intergenic (‑17154/‑56265) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Ser‑GGA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,643,279 | 0 | A | G | 100.0% | 291.1 / NA | 86 | intergenic (‑17154/‑56265) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Ser‑GGA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (43/43); total (43/43) | |||||||||||
GGCTACGACTGTATTCCGACTTCGGAAGGCATCAGCAAAGCCACCACCAGAACCGTTGTACACGCGTCATTAGTAGTATTAGGTTTAGACTTCGTACTGACCGCCATCATGTTCGGTGCGAATTAATCTCTGTTTGTAAGGAAACGTTATGCGACAAACAATTAAATATGAATTTTGGGTCGGTTTATTTTTACTCCTTGGTATCGGCTCGCTTATCTTCTTAGGCTTAAAAGTGGCGAACGTGCAAAGTTTCAGTGAAGCAAAATCTTATCACGTTTATGCAACTTTCGATAATATCGGTGGACTAAAAGTACGCGCCCCGCTTAAAGTGGGCGGCGTTGTGATTGGGCGGGTATCCGAAATCACATTGGATCCGCAAACGTATTTACCGAAAGTCACCATCGCCATTAATCAGGAATACAATGAAATTCCGGAAACCAGTTCGTTATCCATCAAAACCTCCGGTTTATTGGGCGAACAATACATTGCGCTA > 1/1643032‑1643524 | ggCTACGACTGTATTCCGACTTCGGAAGGCATCAGCAAAGCCACCACCAGAACCGTTGTACACGCGTCATTAGTAGTATTAGGTTTAGACTTCGTACTGACCGCCATCATGTTCGGTGCGAATTAATCTCTGTTTGTAAGGAAACGTTATGCGACAAACAATTAAATATGAATTTTGGGTCGGTTTATTTTTACTCCTTGGTATCGGCTCGCTTATCTTCTTAGGCTTAAAAGTGGCGAACGTGCAAGGtt > 1:837441/1‑251 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1:83638/1‑251 (MQ=255) tGGTATCGGCTCGCTTATCTTCTTAGGCTTAAAAGTGGCGAACGTGCAAGGTTTCAGTGAAGCAAAATCTTATCACGTTTATGCAACTTTCGATAATATCGGTGGACTAAAAGTACGCGCCCCGCTTAAAGTGGGCGGCGTTGTGATTGGGCGGGTATCCGAAATCACATTGGATCCGCAAACGTATTTACCGAAAGTCACCATCGCCATTAATCAGGAATACAATGAAATTCCGGAAACCAGTTCGTTAt < 1:211871/251‑1 (MQ=255) gTATCGGCTCGCTTATCTTCTTAGGCTTAAAAGTGGCGAACGTGCAAGGTTTCAGTGAAGCAAAATCTTATCACGTTTATGCAACTTTCGATAATATCGGTGGACTAAAAg < 1:230297/111‑1 (MQ=255) gTATCGGCTCGCTTATCTTCTTAGGCTTAAAAGTGGCGAACGTGCAAGGTTTCAGTGAAGCAAAATCTTATCACGTTTATGCAACTTTCGATAATATCGGTGGACTAAAAGTACGCGCCCCGCTTAAAGTGGGCGGCGTTGTGATTGGGCGGGTATCCGAAATCACATTGGATc > 1:3297/1‑174 (MQ=255) gTATCGGCTCGCTTATCTTCTTAGGCTTAAAAGTGGCGAACGTGCAAGGTTTCAGTGAAGCAAAATCTTATCACGTTTATGCAACTTTCGATAATATCGGTGGACTAAAAGTACGCGCCCCGCTTAAAGTGGGCGGCGTTGTGATTGGGCGGGTATCCGAAATCACATTGGATCCGCAAACGTATTTACCGAAAGTCACCAt > 1:218659/1‑202 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |