| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,399,167 | T→C | intergenic (+66645/+202633) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,399,167 | 0 | T | C | 100.0% | 201.1 / NA | 60 | intergenic (+66645/+202633) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (27/33); total (27/33) | |||||||||||
ACGTGATTAAAACCGATGGCTTCCGCGCTCAAGGAAAGGGAAGAGCATAGATTAACCACATTGGAGACGAAATCGGGATAATCAATCGCCCATTGGG‑TT‑GCCTGCATACCGCC‑AAAGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGTGGATTAATTGAGGACGGACCGGTCGTGCCTTTGCAGCCGCCAAGTACGTTGGAACAAATAAAAAAATAGCGGGAAGTGTCCAATGCTAAGCCATCGCCCATAAAATTTTGCCACCAGCCTTCTTGGTTTGTGCTTTTATCAAAATAAGGTTCGGCGTCGCCGGTAAGCGCGTGGCAGATTAACACCGCATTGCTTTTATCCGCATTCAATTCACCATAGGTTTGATAAGCCACGTCAATTTGTTG > 1/1398928‑1399412 | acgttataaaaaCCGATGGCTCCCGCGCTCAAGGAAAGGGAAGAGCATAGATTACCCACTTGGGAGACGAAATGGGAATAATCAATCGCCCTTGGGG‑TT‑GCCTGCATCCCGCA‑AAGGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTg < 1:321931/242‑1 (MQ=255) tGATAAAACCCGATGGCTCCCGCGCTAAAGGAAGGGGAAGAGCATAGATTACCCACATTGGAGACGAAAGCGGGATAATCAATCGCCCTTTGGG‑TT‑GCCTGCATCCCGCC‑AAAGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTGAgga < 1:66546/251‑1 (MQ=255) ctcccGCGCTCAAGAAAAGGGAAGAGCATAGATTACCCACATGGGAGACGAAAGGGGGATAACCAATCCCCCTTTGGG‑TT‑GCCTGCATCCCG‑C‑AAAGGAAACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTGAGGACGGACCGGTCGTGcc < 1:614313/247‑1 (MQ=255) cTCAAGGAAAGGGAAGAGCATAGATTAACCACATTGGAGACGAAATCGGGATAATCAATCGCCCATTGGG‑TT‑GCCTGCATACCGCC‑AAAGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTGAggac > 1:569848/1‑228 (MQ=255) cTCAAGGAAAGGGAAGAGCATAGATTAACCACATTGGAGACGAAATCGGGATAATCAATCGCCCATTGGG‑TT‑GCCTGCATACCGCC‑AAAGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTGAGGACGGACCGGTCGTGCCTTTGCAgc > 1:502939/1‑250 (MQ=255) cTCAAGGAAAGGGAAGAGCATAGATTAACCACATTGGAGACGAAATCGGGATAATCAATCGCCCATTGGG‑TT‑GCCTGCATACCGCC‑AAAGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTGAGGACGGACCGGTCGTGCCTTTGCAgc > 1:328678/1‑250 (MQ=255) aaaGGGAAGAGCATAGATTACCCACATGGGAGACGAAAGCGGGATAATCAATCGCCCATTGGG‑TT‑GCCTGCATACCGCA‑AAAGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTGAGGACGGACCGGTCGTGCCTTTGc < 1:70599/240‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |