| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,340,408 | T→C | intergenic (+7886/+261392) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,340,408 | 0 | T | C | 100.0% | 282.8 / NA | 80 | intergenic (+7886/+261392) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (37/43); total (37/43) | |||||||||||
TAAAAGTGATGGCGCGTGAGCGTTTGAGTGCGATGGAACAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGTATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATGAAGAATTTACGCAAAAGCTCTTTTCATTACCCGCACAAGTGCG > 1/1340165‑1340648 | tAAAAGTGATGGCGCGTGAGCGTTTGAGTGCGATGGAACAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAAt < 1:389352/251‑1 (MQ=255) aaGTGATGGCGCGTGAGCGTTTGAGTGCGATGGAACAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATAc > 1:49687/1‑250 (MQ=255) gcgcGTGAGCGTTTGAGTGCGATGGAACAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGc > 1:801874/1‑250 (MQ=255) gAGTGCGATGGAACAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAg > 1:697211/1‑251 (MQ=255) cGATGGAACAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTAttt > 1:5840/1‑251 (MQ=255) tGGAACAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGAc < 1:708644/251‑1 (MQ=255) gAACAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATg < 1:550436/232‑1 (MQ=255) gAACAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATCGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGAc < 1:442638/249‑1 (MQ=255) cAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTacac < 1:186275/251‑1 (MQ=255) aTGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTacacac < 1:895461/251‑1 (MQ=255) gTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACAtt > 1:132162/1‑251 (MQ=255) gTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACAtt > 1:313243/1‑251 (MQ=255) gTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACAtt > 1:845665/1‑251 (MQ=255) ttCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAAt > 1:86629/1‑207 (MQ=255) tCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTAt > 1:570277/1‑251 (MQ=255) tGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATcc < 1:147540/251‑1 (MQ=255) gggTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTATGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACAt < 1:773472/244‑1 (MQ=255) gtgACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCACTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATg < 1:795929/214‑1 (MQ=255) cGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTa > 1:224555/1‑221 (MQ=255) cAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAg > 1:620254/1‑251 (MQ=255) tttGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGttt < 1:383262/251‑1 (MQ=255) aaaGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAatat < 1:217014/249‑1 (MQ=255) cGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAggg < 1:137572/251‑1 (MQ=255) gtgtTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTaaa < 1:315766/167‑1 (MQ=255) gtgtTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGAc < 1:602333/201‑1 (MQ=255) gtgtTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTac < 1:136082/204‑1 (MQ=255) gtgtTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTa > 1:164407/1‑212 (MQ=255) gtgtTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAgg < 1:716794/248‑1 (MQ=255) gtgtTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGc < 1:400592/250‑1 (MQ=255) gtgtTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGc < 1:793272/250‑1 (MQ=255) gtgtTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCa > 1:670765/1‑251 (MQ=255) gtgtTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCa > 1:135717/1‑251 (MQ=255) gtTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATAccc > 1:498856/1‑170 (MQ=255) ttGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAGACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAAt < 1:115655/251‑1 (MQ=255) gTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATg > 1:579391/1‑164 (MQ=255) cTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATaaaa > 1:342499/1‑251 (MQ=255) aTTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTAt < 1:830707/167‑1 (MQ=255) aGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGaa < 1:250653/250‑1 (MQ=255) ggTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGaaaa > 1:413918/1‑251 (MQ=255) gtgtgtCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACAtt > 1:566852/1‑159 (MQ=255) aTAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGAtg < 1:16158/250‑1 (MQ=255) gggCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAgg > 1:232243/1‑185 (MQ=255) gggCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGtt > 1:139138/1‑251 (MQ=255) gCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAAc > 1:509999/1‑173 (MQ=255) cGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTgg < 1:399219/250‑1 (MQ=255) ttATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAAc > 1:330152/1‑170 (MQ=255) ttATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGgtgt < 1:318165/251‑1 (MQ=255) aTTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATcc > 1:842267/1‑145 (MQ=255) aTTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGttt < 1:336988/251‑1 (MQ=255) aaaCACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTacacac < 1:548008/123‑1 (MQ=255) aaCACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGc < 1:339413/172‑1 (MQ=255) cGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAgg > 1:468066/1‑251 (MQ=255) gATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGgtg > 1:18516/1‑227 (MQ=255) aTCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTAt > 1:306645/1‑104 (MQ=255) tctcAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGGCTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGaa < 1:403292/251‑1 (MQ=255) tctcAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGaa > 1:428695/1‑251 (MQ=255) cAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGAtgtg < 1:9414/216‑1 (MQ=255) aaCAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCg > 1:51168/1‑251 (MQ=255) aaCAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCg < 1:833393/251‑1 (MQ=255) cAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGAtg < 1:215191/211‑1 (MQ=255) gATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTAcacaca < 1:45928/108‑1 (MQ=255) gATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGa < 1:527710/248‑1 (MQ=255) aTTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTTGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTTGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGAt < 1:448359/248‑1 (MQ=255) ttGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTacac < 1:632159/103‑1 (MQ=255) aaGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGa < 1:355849/250‑1 (MQ=255) gggCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGc > 1:405384/1‑246 (MQ=255) ggCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATgaa > 1:813505/1‑251 (MQ=255) atatCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACA‑TAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATGAAGAATTTa > 1:27964/1‑250 (MQ=255) cTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGgtg < 1:573881/185‑1 (MQ=255) gggCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAg < 1:526540/185‑1 (MQ=255) ggCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATGAAGAATTTACGCAAAAGCTCTTTTCATTAcc < 1:279017/250‑1 (MQ=255) gCAATATTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAACGATGAAGAATTTACGCAAAAGCTCTTTTCATTAccc < 1:417541/250‑1 (MQ=255) atatTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGAc > 1:83612/1‑58 (MQ=255) atatTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATGAAGAATTTa < 1:606266/224‑1 (MQ=255) atatTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATGAAGAATTTACGCAAAAGCTCTTTTCAtt < 1:16153/243‑1 (MQ=255) atatTGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATGAAGAATTTACGCAAAAGCTCTTTTCATTAccc > 1:95764/1‑247 (MQ=255) ttGTGTTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATGAAGAATTTACGCAAAAGCTCTTTTCATTACCCGCACAAg < 1:848134/251‑1 (MQ=255) gtgtTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAggg > 1:716013/1‑101 (MQ=255) gtTAATGAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATGAAGAATTTACGCAAAAGCTCTTTTCATTACCCGCACAAGTGCg > 1:603660/1‑251 (MQ=255) gAGGCATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATGAAGAATTTACGCAAAAGCTCTTTTc > 1:816616/1‑227 (MQ=255) | TAAAAGTGATGGCGCGTGAGCGTTTGAGTGCGATGGAACAATGGTTCTGGGGTGTGACGCAATTTGCCTTGGCAGAGAAAGCGGTGTTTAACCATTCGGATTGGTATTTCTTATTGAAAGATTCGCCGGTGGGAGGTGTGTCGATAGGGCGTTATTTGTTACCGAAGAAAACACGATCTCAACAGATTGAAGGGCTGGAATATCGTTTAAATCAGCCTTTAGGGCAATATTGTGTTAATGAGGTATTAAATACCCAAACGCCAAATGCAACATTAGTATTTGACTACACACATTATCCTGAAAAAATCAGTTTATTGGAACAATATAAAGGGCAATCGGGCTGGTTAAAATTGGATAAAATTTGCGTAACATCACCTGTGGAAAAACAAGATGTGTTGGTGTTTAGCGTTTGCGATCAACAAGGGAATGCGATTAGCGATGAAGAATTTACGCAAAAGCTCTTTTCATTACCCGCACAAGTGCG > 1/1340165‑1340648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |