| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,243,812 | T→C | intergenic (‑133458/‑62657) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,243,812 | 0 | T | C | 100.0% | 126.1 / NA | 37 | intergenic (‑133458/‑62657) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (16/21); total (16/21) | |||||||||||
TAATTTGGGTAAGTATTATCCTCTTGGCAACTTATTTAGTTGGCTTGTTTGGGTTAAAAAAAGCCAGACCATTCATGACCGATTACTGCATGAATCTGTTGCGGACTTATATTCTGTGTAATGTCTTCTTTATTCCGGTTATTCTTGGTTACATCCTGACAGTTGGAAAAGTTAATTATCTTTTCGCAATCTTCTATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATATTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCTATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTATCGTCGGATATTCCCGCCCACATTTCAAAACAGTATTTGACTCATTAGAAATTGAAGGCAAAGCCTATTACATATTAGCAAAATACAGTGACACTTTTATCTTAGCGAAAAGTACTCGTGCTACTAATGAC > 1/1243572‑1244053 | tAATTTGGGTAAGTATTATCCTCTTGGCAACTTATTTAGTTGGCTTGTTTGGGTTAAAAAAAGCCAGACCATTCATGACCGATTACTGCATGAATCTGTTGCGGACTTATATTCTGTGTAATGTCTTCTTTATTCCGGTTATTCTTGGTTACATCCTGACAGTTGGAAAAGTTAATTATCTTTTCGCAATCTTCTATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATACTCACAAGcac < 1:2770/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gTCTTCTTTATTCCGGTTATTCTTGGTTACATCCTGACAGTTGGAAAAGTTAATTATCTTTTCGCAATCTTCTATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATACTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTAt < 1:418161/158‑1 (MQ=255) tcttTATTCCGGTTATTCTTGGTTACATCCTGACAGTTGGAAAAGTTAATTATCTTTTCGCAATCTTCTATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATACTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCTATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTATCGTCGGATATTCCCGCCCACAttt > 1:457845/1‑250 (MQ=255) ggTTACATCCTGACAGTTGGAAAAGTTAATTATCTTTTCGCAATCTTCTATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATACTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCTATTGTTATTTTg < 1:465678/190‑1 (MQ=255) cATCCTGACAGTTGGAAAAGTTAATTATCTTTTCGCAATCTTCTATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATACTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCTATTGTTATTTTGTAATATGTGCGtt < 1:114795/198‑1 (MQ=255) 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> 1:49950/1‑166 (MQ=255) cttctATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATACTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCTATTGTTATTTTGTAATATGTGCg > 1:584168/1‑157 (MQ=255) cttctATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATACTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCTATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTATCGTCGGATATTCCCGCCCACATTTCAAAACAGTATTTGACTCATTAGAAATTGAAGGCAAAGCCTATTACGTATTAGCAAAATAc < 1:208004/247‑1 (MQ=255) atatTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATACTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCTATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTAtcgtc < 1:895919/161‑1 (MQ=255) atatTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATACTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCTATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTATCGTCGGATATTCCCGCCCACATTTCAAAACAGTATTTGACTCATTAGAAATTGAAGGCAAAGCCTATTAc > 1:867881/1‑227 (MQ=255) 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> 1/1243572‑1244053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |