| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 296,225 | A→G | intergenic (‑27947/+50279) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 296,225 | 0 | A | G | 100.0% | 285.1 / NA | 84 | intergenic (‑27947/+50279) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (48/36); total (48/36) | |||||||||||
TCGCTTGACCTTTAATAAGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAACTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGATTAGAGCATTTT > 1/295981‑296454 | tCGCTTGACCTTTAATAAGGTTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATg > 1:11421/1‑251 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1:697901/1‑236 (MQ=255) cAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTtaata < 1:26933/202‑1 (MQ=255) aaaTGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTAcc > 1:59361/1‑138 (MQ=255) aTGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGTACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTaa > 1:250189/1‑251 (MQ=255) gTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATc > 1:599331/1‑229 (MQ=255) 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TCGCTTGACCTTTAATAAGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAACTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGATTAGAGCATTTT > 1/295981‑296454 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |