| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,038,335 | C→A | intergenic (‑35262/+14578) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,038,335 | 0 | C | A | 100.0% | 172.2 / NA | 51 | intergenic (‑35262/+14578) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (24/27); total (24/27) | |||||||||||
GTTCTAGGGTAGGTTGTTGCTTTGTGGGTTTCGTATAAGGATTGAGCAATATCTAATACCTGCTGAGCGCCTAATCCGTACAAACGGTTTGCTTCACTTTGTAAATCGCTTAGTGCAAATAGCAGCGGGGCACTTTGTTTCTCCCGCTTGGTCTCTACTGACTCCACTTTCATTACGCCGGCTTGTTGCACTTGTTGATTCACTGCTTGTATCGTTTGTTGGGATAAACAGAGTCCGTCCTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCC > 1/1038094‑1038579 | gTTCTAGGGTAGGTTGTTGCTTTGTGGGTTTCGTATAAGGATTGAGCAATATCTAATACCTGCTGAGCGCCTAATCCGTACAAACGGTTTGCTTCACTTTGTAAATCGCTTAGTGCAAATAGCAGCGGGGCACTTTGTTTCTCCCGCTTGGTCTCTACTGACTCCACTTTCATTACGCCGGCTTGTTGCACTTGTTGATTCACTGCTTGTATCGTTTGTTGGGATAAACAGAGTCCGTCCTAATCACAgtg > 1:363102/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |