| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,030,583 | C→A | intergenic (‑27510/+22330) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,030,583 | 0 | C | A | 100.0% | 159.3 / NA | 48 | intergenic (‑27510/+22330) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (23/25); total (23/25) | |||||||||||
TCAATTTCTGTCCCAAAACCATTAAAGGCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGCATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTTTATTATTCACATAAGAGAGAATTCGTCCAATGTCCGTGTCACATTTTTCACAATTATCCAACCGGGTAAAATACAATACCCTTCCCGCACTTTGCGATACATGTGGCTCGACATTAAACGGAAGCTCATCTGGGTAAAGTTCAGCTATGGCTTTATCATAAGCACGTTGAAAG > 1/1030346‑1030803 | tCAATTTCTGTCCCAAAACCATTAAAGGCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATga > 1:799183/1‑251 (MQ=255) gTCCCAAAACCATTAAAGGCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCg > 1:108021/1‑251 (MQ=255) aaaaCCATTAAAGGCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAAc < 1:337839/251‑1 (MQ=255) aTTAAAGGCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAat > 1:715096/1‑251 (MQ=255) ggCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGa > 1:545299/1‑250 (MQ=255) gAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTttat > 1:208599/1‑251 (MQ=255) tAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTttatta < 1:62464/250‑1 (MQ=255) ggCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAata < 1:605684/225‑1 (MQ=255) ggCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCG‑CCATTTACGAATGGAATCATCGTCATTACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGGTTTATTATTCACATaa > 1:853157/1‑251 (MQ=255) cAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTTTATTATTCACATAag < 1:588075/251‑1 (MQ=255) 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< 1:318566/178‑1 (MQ=255) gTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCg > 1:527332/1‑193 (MQ=255) gTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTttat < 1:62587/221‑1 (MQ=255) gTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTTTATTATTCACATAAGAGAGAATTCGTCCAATGt > 1:683949/1‑251 (MQ=255) 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ttGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTTTATTATTCACATAAGAGAGAATTCGTCCAATGTCCGTGTCACATTTTTCACAATTATCCAACCGGGTAAaataca > 1:138281/1‑251 (MQ=255) aaTGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTTTATTATTCACATAAGAGAGAATTCGTCCAATGTCCGTGTCACATTTTTCACAATTATCCAACCGGGTAAaatacaatac < 1:346601/251‑1 (MQ=255) aaTGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTTTATTATTCACATAAGAGAGAATTCGTCCAATGTCCGTGTCACATTTTTCACAATTATCCAACCGGGTAAaatacaatac < 1:714669/251‑1 (MQ=255) 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ccATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTttat > 1:474104/1‑151 (MQ=255) ccATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTTTATTATTCACATAAGAGAGAATTCGTCCAATGTCCGTGTCACATTTTTCACAATTATcc < 1:314802/207‑1 (MQ=255) catattacaccGGTTTCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTTTATTATTCACATAAGAGAGAATTCGTCCAATGTCCGTGTCACATTTTTCACAATTATCCAACCGGGTAAAATACAATACCCTTCCCGCACTTTGCGATACATGTGGCTCGAc < 1:855515/242‑1 (MQ=255) gCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTttat > 1:195779/1‑141 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |