| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 779,173 | T→C | intergenic (+44300/+42660) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 779,173 | 0 | T | C | 100.0% | 193.0 / NA | 55 | intergenic (+44300/+42660) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (25/30); total (25/30) | |||||||||||
CTATATTACAAATTCACGCCCTTTTGCCAAGAAAGCGGAAATATAAACCCTGCCATTCCGCACAATAAATTTTACGCTATGCCCGTTTTTAACCGTATAGATATGAAATCGACCATCATTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAGCGAAAAGAAACTTCCCTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAACGAGCTTTTTCTAAAAGCTGTTGTTCCGCTTCTTCCATCCAAACTACGGTGTAATCCAATTTCATTTTAAGCCCAATACTTTTTCCAGGTTAGCTAATACTTCTTCATTGGATTTGACTTTAATTTCTCCGTTATCTAGCCGTGCAAAAAATAACGCTTCTTCGGAAAGCGTCACTTTTTGTGGTAGGTAGTCATCTTTACGATAGTTATTC‑TGTGTATTTAAGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATC > 1/778933‑779414 | cTATATTACAAATTCCCGCCCTTTTGCTAAGAAAGCGGAAATATAAACCCTGTCATTCCGCACAATAAATTTTACGCTATGCCCGTTCTTAACCGTATAGATATGAAATCGACCATCATTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGctt > 1:247630/1‑251 (MQ=255) 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CTATATTACAAATTCACGCCCTTTTGCCAAGAAAGCGGAAATATAAACCCTGCCATTCCGCACAATAAATTTTACGCTATGCCCGTTTTTAACCGTATAGATATGAAATCGACCATCATTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAGCGAAAAGAAACTTCCCTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAACGAGCTTTTTCTAAAAGCTGTTGTTCCGCTTCTTCCATCCAAACTACGGTGTAATCCAATTTCATTTTAAGCCCAATACTTTTTCCAGGTTAGCTAATACTTCTTCATTGGATTTGACTTTAATTTCTCCGTTATCTAGCCGTGCAAAAAATAACGCTTCTTCGGAAAGCGTCACTTTTTGTGGTAGGTAGTCATCTTTACGATAGTTATTC‑TGTGTATTTAAGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATC > 1/778933‑779414 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |