| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 200,155 | G→A | intergenic (+64033/+62994) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 200,155 | 0 | G | A | 100.0% | 328.5 / NA | 97 | intergenic (+64033/+62994) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (41/56); total (41/56) | |||||||||||
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tttttAGCATGGTCGGAAGCTCGCCGTTCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACa < 1:605965/251‑1 (MQ=255) ttttAGCATGGTCGGAAGCTCGCCGTTCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACAt < 1:311907/251‑1 (MQ=255) ggTCGGAAGCTCGCCGTTCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCa > 1:301204/1‑199 (MQ=255) 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tCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCAttatta < 1:773826/251‑1 (MQ=255) tCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAACTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCAttatta < 1:425008/251‑1 (MQ=255) cGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAg > 1:419635/1‑70 (MQ=255) cGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCAttattat > 1:720120/1‑250 (MQ=255) 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CATTTATTCATATACCAACTTCAGCAGATTTAATTCAATATCAAAAACAGCTATCTCATGATGCTTCCGGATTACCTAAATTCGGCACGGTTTTAAGCATGATTGTGTTTCCGCTCGTATTAATTATGTTGGGCACGATCACAGCAGTAACTTTACCAAAAGAACATATAATCCGTGAAATTTTTAGCATGGTCGGAAGCTCGCCGTTCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTGTGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCATTATTACGCGCAGCACAAGGTTCTGCGACAGTG > 1/199915‑200399 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |