| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 687,069 | T→C | intergenic (+196154/‑9639) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 687,069 | 0 | T | C | 100.0% | 256.4 / NA | 73 | intergenic (+196154/‑9639) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (31/42); total (31/42) | |||||||||||
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1:799501/202‑1 (MQ=255) gaagCAAACCGCTTAAAGGGTAACACAGGTGAAAATCTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGTCGTGTGGTAAACATTCCATCTTTCCAGGTTTCAGTTGATGATGTAGTTGCTGt < 1:324420/203‑1 (MQ=255) gCTTAAAGGGTAACACAGGTGAAAATCTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGTCGTGTGGTAAACATTCCATCTTTCCAGGTTTCAGTTGATGGTGTAGTTGCTGTTCGTGAAAAATCTAAGAAACAAGCACGTATTAAAGCATCATTGGAATTGGcagaacag > 1:605067/1‑251 (MQ=255) gCTTAAAGGGTAACACAGGTGAAAATCTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGTCGTGTGGTAAACATTCCATCTTTCCAGGTTTCAGTTGATGATGTAGTTGCTGTTCGTGAAAAATCTAAGAAACAAGCACGTATTAAAGCATCATTGGAATTGGcagaacag > 1:302715/1‑251 (MQ=255) gCTTAAAGGGTAACACAGGTGAAAATCTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGTCGTGTGGTAAACATTCCATCTTTCCAGGTTTCAGTTGATGATGTAGTTGCTGTTCGTGAAAAATCTAAGAAACAAGCACGTATTAAAGCATCATTGGAATTGGcagaacag > 1:623367/1‑251 (MQ=255) cTTAAAGGGTAACACAGGTGAAAATCTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGTCGTGTGGTAAACATTCCATCTTTcc < 1:794198/164‑1 (MQ=255) gggTAACACAGGTGAAAATCTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGTCGTGTGGTAAAc < 1:507869/145‑1 (MQ=255) gggTAACACAGGTGAAAATCTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGTCGTGTGGTAAACATTCCATCTTTCCAGGTTTCAGTTGATGATGTAg < 1:676209/179‑1 (MQ=255) gggTAACACAGGTGAAAATCTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGTCGTGTGGTAAACATTCCATCTTTCCAGGTTTCAGTTGATGATGTAGTTGCTGTTCGTGAAAAATCTAAGAAACAAGCACGTATTAAAGCATCATTGGAATTGGcagaacag < 1:833380/244‑1 (MQ=255) ggTGAAAATCTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGt < 1:81207/123‑1 (MQ=255) ggTGAAAATCTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGTCGTGTGGTAAACATTCCATCTTTCCAGGTTTCAGTTGATGATGTAGTTGCTGTTCGTGAAAAATCTAAGAAACAAGCACGTATTAAAGCATCATTGGAATTGGCAGAACAGAAAGAAAAACCGACATg > 1:287583/1‑251 (MQ=255) | ACTCAAGCTAAGCCGCCGTGAAGGCACTGATTTATTTCTTAAATCAGGTGTTCGTGCGATTGATTCAAAATGTAAAATTGATATCGCGCCTGGTCAACATGGTGCTCGTAAACCGCGTCTGTCTGACTATGGTAGTCAGTTGCGTGAGAAACAAAAAGTTCGCCGTATGTACGGTATTTTGGAACGCCAATTCCGTAATTACTACAAAGAAGCAAACCGCTTAAAGGGTAACACAGGTGAAAATTTATTAGTGTTGCTTGAAGGTCGATTGGATAATATAGTTTATCGTATGGGGTTCGCAGCCACTCGCGCAGAGGCTCGCCAATTGGTAAGTCATAAAGCGATTGTTGTTAATGGTCGTGTGGTAAACATTCCATCTTTCCAGGTTTCAGTTGATGATGTAGTTGCTGTTCGTGAAAAATCTAAGAAACAAGCACGTATTAAAGCATCATTGGAATTGGCAGAACAGAAAGAAAAACCGACATG > 1/686825‑687310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |