| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,918,116 | (TTTG)28→12 | intergenic (+68740/‑81813) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1918116 | 1918179 | 64 | 74 [1] | [0] 74 | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1918115 | 1 (0.010) | 61 (0.900) | 43/334 | 0.4 | 99.4% | intergenic (+68739/‑81877) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| ? | 1 | 1918180 = | 0 (0.000) | intergenic (+68804/‑81812) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC | |||||
ATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATCCCTAAATGCCAGCGCGTTGCGGCTAATGCCCGGCTGTACCTCAATGCGCAGACGAATTTTATCCACATTTTGCGCGAGGCTGTCAGCCACTTGTTGCGGATGCCAATCGTCAGTTGTCCAGTCGCCCAAAAGCTCGGATGGGTATGAT > 1/1917937‑1918430 | aagatcgcgagtttatcggctcaaataaagaatatccgttgtagccgaccacgcgagtttagaaatttaaccagttaaatttagaagaggaatttctaattttatgcgaacttaggaagacaataacgctacaccaattttacctatcaacaccgactaatggtaggggtgcttgtttaaacatagcacgctccttttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgCATTGtat < 1:118279‑M2/8‑1 (MQ=255)aagatcgcgagtttatcggctcaaataaagaatatccgttgtagccgaccacgcgagtttagaaatttaaccagttaaatttagaagaggaatttctaattttatgcgaacttaggaagacaataacgctacaccaattttacctatcaacaccgactaatggtaggggtgcttgtttaaacatagcacgctccttttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgCATTGtat < 1:694098‑M2/8‑1 (MQ=255) atcgcgagtttatcggctcaaataaagaatatccgttgtagccgaccacgcgagtttagaaatttaaccagttaaatttagaagaggaatttctaattttatgcgaacttaggaagacaataacgctacaccaattttacctatcaacaccgactaatggtaggggtgcttgtttaaacatagcacgctccttttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgCATTGTATATg < 1:644933‑M2/11‑1 (MQ=255) cgcgagtttatcggctcaaataaagaatatccgttgtagccgaccacgcgagtttagaaatttaaccagttaaatttagaagaggaatttctaattttatgcgaacttaggaagacaataacgctacaccaattttacctatcaacaccgactaatggtaggggtgcttgtttaaacatagcacgctccttttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgCATTGTATATGTc < 1:362693‑M2/13‑1 (MQ=255) 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ATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATCCCTAAATGCCAGCGCGTTGCGGCTAATGCCCGGCTGTACCTCAATGCGCAGACGAATTTTATCCACATTTTGCGCGAGGCTGTCAGCCACTTGTTGCGGATGCCAATCGTCAGTTGTCCAGTCGCCCAAAAGCTCGGATGGGTATGAT > 1/1917937‑1918430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |