| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 702,780 | (ATATA)2→1 | intergenic (+1126/‑10048) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Pro‑TGG |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 702780 | 702784 | 5 | 77 [0] | [0] 75 | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Pro‑TGG |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 702779 | 0 (0.000) | 73 (0.850) | 49/420 | 0.5 | 100% | intergenic (+1125/‑10053) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Pro‑TGG |
| ? | 1 | 702785 = | 0 (0.000) | intergenic (+1131/‑10047) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Pro‑TGG | |||||
GGCATGGACTTCCTACTTAAGGGAAAGTTTATCACTTAAATACGGTTCGGTAGTATCAATGCCTTACCAATATATTGCCGTAGCAATAGCCGGATTAGGAATGGTATTTACTCTGGGGTTAGACTTATCCCAGATCAAAATTATTTTCAGTAGCCCGCTTTTAATTGCTTTATTGATCTTTCTTGGAATGGGTATTTCCGGCGGTAGTTATTTAATCCAGCTTTACTCTTTCAAACATCATATAATATAGGTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCATTATTAGGATATGTAACGTAATCATAACATTAGGTGAAGAAATGGTACTTAGCAAAACAATCATTGTCACAATCATAGTAATTGCATTGTATGTTTTCACTCAGTATGGCGATAAAGGAGAGAACTAACATAAAGGAGAAAAATTTATCTATAAGTAAAACCCTGCATATTACTATCTTATTAAATGTCAAATACCAGGTTTTCCTAATA > 1/702536‑703033 | tcactggcatggacttcctacttaagggaaagtttatcacttaaatacggttcggtagtatcaatgccttaccaatatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatatagg < 1:843473‑M2/2‑1 (MQ=255)tcactggcatggacttcctacttaagggaaagtttatcacttaaatacggttcggtagtatcaatgccttaccaatatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatatagg < 1:732663‑M2/2‑1 (MQ=255)tcactggcatggacttcctacttaagggaaagtttatcacttaaatacggttcggtagtatcaatgccttaccaatatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatatagg < 1:770436‑M2/2‑1 (MQ=255) gcatggacttcctacttaagggaaagtttatcacttaaatacggttcggtagtatcaatgccttaccaatatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatatagg > 1:168091‑M2/244‑245 (MQ=255) 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1:312172‑M2/159‑1 (MQ=255) tcatataGGTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCATTATTAGGATATGTAACGTAATCATAACATTAGGTGAAGAAATGGTACTTAGCAAAACAATCATTGTCACAATCATAGTAATTGCATTGTATGTTTTCACTCAGTATGGCGATAAAGGAGAGAACTAACATAAAGGAGAAAAATTTATc > 1:44480‑M2/8‑195 (MQ=255) tcatataGGTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCATTATTAGGATATGTAACGTAATCATAACATTAGGTGAAGAAATGGTACTTAGCAAAACAATCATTGTCACAATCATAGTAATTGCATTGTATGTTTTCACTCAGTATGGCGATAAAGGAGAGAACTAACATAAAGGAGAAAAATTTATCTATAAGTAAAACCCTGCATATTAc > 1:872925‑M2/8‑219 (MQ=255) catataGGTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCATTATTAGGATATGTAACGTAATCATAACATTAGGTGAAGAAATGGTACTTAGCAAAACAATCATTGTCACAATCATAGTAATTGCATTGTATGTTTTCACTCAGTATGGCGATAAAGGAGAGAACTAACATAAAGGAGAAAAATTTATCTATAAGTAAAACCCTGCATATTACTATCTTATTAAATGTCAAATACCAGGTTTTCCt < 1:625098‑M2/245‑1 (MQ=255) taGGTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCATTATTAGGATATGTAACGTAATCATAACATTAGGTGAAGAAATGGTACTTAGCAAAACAATCATTGTCACAATCATAGTAATTGCATTGTATGTTTTCACTCAGTATGGCGATAAAGGAGAGAACTAACATAAAGGAGAAAAATTTATCTATAAGTAAAACCCTGCATATTACTATCTTATTAAATGTCAAATACCAGGTTTTCCTAata < 1:197272‑M2/249‑1 (MQ=255) ggTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCATTATTAGGATATGTAACGTAATCATAACATTAGGTGAAGAAATGGTACTTAGCAAAACAATCATTGTCACAATCATAGTa > 1:540616/1‑119 (MQ=255) | GGCATGGACTTCCTACTTAAGGGAAAGTTTATCACTTAAATACGGTTCGGTAGTATCAATGCCTTACCAATATATTGCCGTAGCAATAGCCGGATTAGGAATGGTATTTACTCTGGGGTTAGACTTATCCCAGATCAAAATTATTTTCAGTAGCCCGCTTTTAATTGCTTTATTGATCTTTCTTGGAATGGGTATTTCCGGCGGTAGTTATTTAATCCAGCTTTACTCTTTCAAACATCATATAATATAGGTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCATTATTAGGATATGTAACGTAATCATAACATTAGGTGAAGAAATGGTACTTAGCAAAACAATCATTGTCACAATCATAGTAATTGCATTGTATGTTTTCACTCAGTATGGCGATAAAGGAGAGAACTAACATAAAGGAGAAAAATTTATCTATAAGTAAAACCCTGCATATTACTATCTTATTAAATGTCAAATACCAGGTTTTCCTAATA > 1/702536‑703033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |