| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | 1 | = 1718830 | 66 (0.860) | 300 (3.630) +TTCTCTTTCTCT |
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| ? | 1 | 1718831 = | NA (NA) | intergenic (‑470/+114) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 400 total aligned reads displayed.
ATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTGGGAGAACTCATCTCTTGG > 1/1718580‑1719074 | aTCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTttc < 1:607704/251‑1 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tttCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCTTCTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCttctctttctcttt > 1:901241‑M1/1‑236 (MQ=255) tttCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCttctctttctcttt > 1:768300‑M1/1‑236 (MQ=255) ttCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCttctctttctctttctctttc < 1:462887‑M1/251‑22 (MQ=255) 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1:63757‑M1/1‑78 (MQ=255) ataCGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCttctctttctctttctctttctctttctctttctctttatctttctctttaatttaatctaataccgttattc > 1:351696‑M1/1‑78 (MQ=255) ccTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGcc < 1:564150/251‑1 (MQ=255) ccTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCCTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGcc < 1:453732/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ctctCCTGAGCTACAATCCTTTTTCttctctttctctttctctttctctttctctttctctttatctttctctttaatttaatctaataccgttattcttatcaacacatcccctgcgctcctgccccccgcaaaaacacttgagcgttgtatggctaagcccctcgggcaattagtacgtgttagctcaacatatcactacgcttacacaccacgcctatctacgtcatagtctttaacaacccttacag < 1:490966‑M1/251‑227 (MQ=255) ctcCTGAGCTACAATCCTTTTTCttctctttctctttctctttctctttctctttctctttatctttctctttaatttaatctaataccgttattcttatcaacacatcccctgcgctcctgccccccgcaaaaacacttgagcgttgtatggc > 1:808198‑M1/1‑23 (MQ=255) tcCTGAGCTACAATCCTTTTTCttctctttctctttctctttctctttctctttctctttatctttctctttaatttaatctaataccgttattcttatcaacacatcccctgcgctcctgccccccgcaaaaacacttgagcgttgtatggctaagcccctcgggcaattagtacgtgttagctcaacatatcactacgcttacacaccacgcctatctacgtcatagtctttaacaacccttacagacc < 1:536332‑M1/251‑230 (MQ=255) gAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCAt < 1:210908/211‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |