| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,337,311 | (CACCT)8→5 | intergenic (+4789/+264475) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1337298 = | 3 (0.030) | 53 (0.700) | 37/374 | 0.8 | 95.0% | intergenic (+4776/+264502) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | = 1337282 | 3 (0.040) | intergenic (+4760/+264518) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
TAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCCCGCTATTACGACAACG > 1/1337059‑1337546 | cgtttccgaagtgcgtaacggcatggaatgcggtatcggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgcctcacctcacc > 1:727411‑M1/240‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) attcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCAGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTc < 1:609141‑M1/153‑1 (MQ=255) ttcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCt < 1:807307‑M1/155‑1 (MQ=255) gtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCaaaaaa < 1:428945‑M1/162‑1 (MQ=255) 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tgCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATc < 1:136017‑M1/43‑1 (MQ=255) tgCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCCCGCTATTACGACAACg < 1:132164‑M1/249‑1 (MQ=255) | TAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCCCGCTATTACGACAACG > 1/1337059‑1337546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |