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gATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCg > 1:225279/1‑251 (MQ=255) aTTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGt < 1:492569/212‑1 (MQ=255) aaaCAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTc < 1:217348/186‑1 (MQ=255) aaCCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTc < 1:808093/165‑1 (MQ=255) ccccAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTctaaa > 1:298488/1‑251 (MQ=255) ccccAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTctaaa > 1:200988/1‑251 (MQ=255) | TTGATGAAAGTGAACCGGAAATTATTCAGCACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAGAAAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAA > 1/1999696‑2000178 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |