| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 6 | 91 | 2 bp→CC | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 6 | 91 | 0 | T | C | 100.0% | 143.0 / NA | 43 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (18/25); total (18/25) | |||||||||||
| * | 6 | 92 | 0 | A | C | 100.0% | 144.1 / NA | 43 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (18/25); total (18/25) | |||||||||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GG‑AAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAATAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTGTTGCGCG‑CTGATGATTTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATGTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACC > 6/1‑318 || taaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgattgttcttggtggtctggctgaaaataaaataacggaaggtgaaacaggtttttcatttcttcctaaaggttttttaacgggaaaatccaaaaatgatactaaGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTc < 1:21991‑M2/100‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |