| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 540,654 | A→G | D603D (GAT→GAC) | unknown ← | PTS system, mannitol‑specific IIC component / PTS system, mannitol‑specific IIB component (EC 2.7.1.197) / PTS system, mannitol‑specific IIA component (EC 2.7.1.197) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 540,654 | 0 | A | G | 100.0% | 320.1 / NA | 94 | D603D (GAT→GAC) | unknown | PTS system, mannitol‑specific IIC component / PTS system, mannitol‑specific IIB component (EC 2.7.1.197) / PTS system, mannitol‑specific IIA component (EC 2.7.1.197) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (46/48); total (46/48) | |||||||||||
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |