| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 6 | 370 | G→A | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 6 | 370 | 0 | G | A | 100.0% | 83.3 / NA | 26 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (15/11); total (15/11) | |||||||||||
AAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATGTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGGCCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATTCGTAGCGTTTGTTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 6/155‑396 | aaaTTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGACTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAAcatatatta > 1:358946‑M2/1‑242 (MQ=255) 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(MQ=255) ttACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAAcatatat < 1:294688‑M2/125‑8 (MQ=255) gCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAAcat < 1:676356‑M2/114‑4 (MQ=255) tcttcAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAAcatatattatgttaaataaaataaatggtaagtcacttctgggaatttgagatttgctctctttaaaaatgactgggtaaaaaaatttatttcttgaagatttgattttttgagcgtttatgatgatgagatattcgtgagtttttag > 1:352855‑M2/1‑103 (MQ=255) cttcAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAAcatatattatgttaaataaaataaatggtaagtcacttctgggaatttgagatttgctctctttaaaaatgactgggtaaaaaaatttatttcttgaagatttgattttttgagcgtttatgatgatgagatattcgtgagtttttaga < 1:313791‑M2/251‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |