| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 4 | 207 | C→T | S69S (AGC→AGT) | unknown → | putative phage‑related membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 4 | 207 | 0 | C | T | 100.0% | 260.7 / NA | 78 | S69S (AGC→AGT) | unknown | putative phage‑related membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (36/42); total (36/42) | |||||||||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGCGCTTATCTTATGCGTTTTGTTATTCGCCGCATTCCGATTATAGGTTGAGGATTTTATGGCAATTTCGGCTTATGTGGGTATACCGGGTAGCGGTAAATCTTATGAGGTTGTGTCTTCGGTGATTGTTGAGAATTATCTCAAAGGAAGACGCATTGTAACGAATATTGAGGGAATAACAGACGAAAAAGTAAGGGAGTATTGTTTAAACAAAAAGAATGCCAAGGAAGACGATTTAGGGC > 4/1‑446 | attattggctggatagctaaaaattcaggcggattgcttAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGTGctta > 1:816900‑M2/40‑251 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGCGCTTATCTTATGCGTTTTGTTATTCGCCGCATTCCGATTATAGGTTGAGGATTTTATGGCAATTTCGGCTTATGTGGGTATACCGGGTAGCGGTAAATCTTATGAGGTTGTGTCTTCGGTGATTGTTGAGAATTATCTCAAAGGAAGACGCATTGTAACGAATATTGAGGGAATAACAGACGAAAAAGTAAGGGAGTATTGTTTAAACAAAAAGAATGCCAAGGAAGACGATTTAGGGC > 4/1‑446 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |