| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 3 | 1,754 | T→C | Y279Y (TAT→TAC) | unknown → | Type II secretory pathway, component PulD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 3 | 1,754 | 0 | T | C | 100.0% | 198.4 / NA | 59 | Y279Y (TAT→TAC) | unknown | Type II secretory pathway, component PulD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (32/27); total (32/27) | |||||||||||
GGAAAACTCGGGATTAATATAGGCGTTAAGCAGAACTATGAAAACTTTATAACAGTAAATACAGGTAATCTTGATGCTATGATTGAACTTTTTCGTACAGATAGCCGATTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCTATTGAATATCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGCGAAACAGGTTTTTCATTTCTTC > 3/1512‑1992 | tccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAg > 1:604607‑M1/109‑251 (MQ=255)tccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAg > 1:567686‑M1/109‑251 (MQ=255) cttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAg < 1:562704‑M1/143‑1 (MQ=255) cttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTa < 1:901560‑M1/150‑1 (MQ=255) ttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTaa > 1:111505‑M1/101‑251 (MQ=255) taaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAAttt > 1:11707‑M1/98‑251 (MQ=255) acgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCgg < 1:276949‑M1/146‑1 (MQ=255) cgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGAc > 1:257324‑M1/93‑251 (MQ=255) ttgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGc > 1:820997‑M1/86‑251 (MQ=255) gtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCTGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCcg < 1:519034‑M1/168‑1 (MQ=255) tcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCcga < 1:723115‑M1/169‑1 (MQ=255) atgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTa < 1:680278‑M1/175‑1 (MQ=255) aagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGc > 1:447482‑M1/73‑251 (MQ=255) aagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGc > 1:853130‑M1/73‑251 (MQ=255) aaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGataat > 1:652310‑M1/66‑251 (MQ=255) aaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAatat > 1:716587‑M1/64‑251 (MQ=255) aaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAatat > 1:753040‑M1/64‑251 (MQ=255) tgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATaaa > 1:542047‑M1/55‑251 (MQ=255) gatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAGTTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAAt < 1:623800‑M1/200‑1 (MQ=255) agataactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTTCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAatat > 1:428899‑M1/23‑210 (MQ=255) aactgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGa < 1:405378‑M1/233‑1 (MQ=255) actgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGAt < 1:301654‑M1/234‑1 (MQ=255) tgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATAc > 1:266106‑M1/16‑251 (MQ=255) tgaaggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATAc > 1:506595‑M1/16‑251 (MQ=255) ggcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGgt < 1:245335‑M1/240‑1 (MQ=255) gcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAgg > 1:407303‑M1/11‑249 (MQ=255) gcgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAgg > 1:106492‑M1/11‑249 (MQ=255) cgaaacaggTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGgtg > 1:701868‑M1/10‑250 (MQ=255) gTTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTaat > 1:379028‑M1/2‑247 (MQ=255) ttGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGaca > 1:657609/1‑251 (MQ=255) ctctCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATaa < 1:768913/251‑1 (MQ=255) ctcCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATaaaa < 1:216722/251‑1 (MQ=255) ctcCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATaaaa > 1:603086/1‑251 (MQ=255) tcCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAAc < 1:707189/251‑1 (MQ=255) aaaTCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTg > 1:414478/1‑157 (MQ=255) ggCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACGACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAg > 1:454688/1‑251 (MQ=255) gCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAg < 1:523530/250‑1 (MQ=255) ggCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTaaaaa < 1:278498/250‑1 (MQ=255) aTTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATaaaa > 1:737541/1‑215 (MQ=255) cGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGc < 1:717171/120‑1 (MQ=255) ggCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAgg > 1:788929/1‑176 (MQ=255) gCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATaa < 1:274985/201‑1 (MQ=255) gCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGAt < 1:590501/221‑1 (MQ=255) gATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATaaaa < 1:699330/198‑1 (MQ=255) aTGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTtggt < 1:516623/251‑1 (MQ=255) tGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTtggt < 1:233933/250‑1 (MQ=255) cTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTc < 1:622360/240‑1 (MQ=255) aTTCTTGGCTCGGTTACTTATGGTAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTtggt < 1:178328/243‑1 (MQ=255) cGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTg > 1:893448/1‑225 (MQ=255) gTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAg < 1:787049/200‑1 (MQ=255) gTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGaaaataaaat > 1:772789/1‑251 (MQ=255) ttACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTaaaaa > 1:826039/1‑207 (MQ=255) aCTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAAc < 1:395749/251‑1 (MQ=255) gtcgtcCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAg < 1:291222/181‑1 (MQ=255) gtccaTTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGca > 1:205139/5‑84 (MQ=255) gtccaTTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATaaa > 1:363159/5‑144 (MQ=255) ccaTTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTCAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATttcttc > 1:423691/3‑249 (MQ=255) aTTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATAc < 1:402653/110‑1 (MQ=255) aTTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTc > 1:313041/1‑190 (MQ=255) | GGAAAACTCGGGATTAATATAGGCGTTAAGCAGAACTATGAAAACTTTATAACAGTAAATACAGGTAATCTTGATGCTATGATTGAACTTTTTCGTACAGATAGCCGATTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCTATTGAATATCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGCGAAACAGGTTTTTCATTTCTTC > 3/1512‑1992 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |