| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,143,665 | T→C | intergenic (+163/‑5) | unknown → / → unknown | Murein‑DD‑endopeptidase (EC 3.4.99.‑)/Chromosome partition protein MukF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,143,665 | 0 | T | C | 100.0% | 178.9 / NA | 52 | intergenic (+163/‑5) | unknown/unknown | Murein‑DD‑endopeptidase (EC 3.4.99.‑)/Chromosome partition protein MukF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (37/15); total (37/15) | |||||||||||
ACTTTGTGGATGATATGCAGTATGAAGAGGGCTATGATGAAGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCTCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTATAATAACGAACGTTTTGACGGTGAAATGATCGAATCGGATCTGGTGGACATTTTTCGCCACGTTTCCGGCGCCTTTGACCAATCCCAGGAAACCATTGCTACCCGCGCCAATAACGCCATTAACG > 1/2143423‑2143907 | aCTTTGTGGATGATATGCAGTATGAAGAGGGCTATGATGAAGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATTTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGCTTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGCTAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATg > 1:178034/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |