| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,133,627 | G→A | S237S (TCG→TCA) | unknown → | Limit dextrin alpha‑1,6‑maltotetraose‑hydrolase (EC 3.2.1.196) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,133,627 | 0 | G | A | 100.0% | 244.1 / NA | 72 | S237S (TCG→TCA) | unknown | Limit dextrin alpha‑1,6‑maltotetraose‑hydrolase (EC 3.2.1.196) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (38/34); total (38/34) | |||||||||||
GTTGAGTGTGAAAGGTTTTACCAAATTACAAACGGAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCGCAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAACTGGACCGGTTGCGGCAATATGCTGAATTTGTCCAATCACATTACCCGTCG > 1/2133387‑2133872 | gttgagtGTGAAAGGTTTTACCAAATTACAAACGGAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAata > 1:774650/1‑251 (MQ=255) ttgagtGTGAAAGGTTTTACCAAATTACAAACGGAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAatat < 1:37852/251‑1 (MQ=255) ttgagtGTGAAAGGTTTTACCAAATTACAAACGGAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAatat < 1:715199/251‑1 (MQ=255) agtGTGAAAGGTTTTACCAAATTACAAACGGAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATgg < 1:683639/250‑1 (MQ=255) gtgtGAAAGGTTTTACCAAATTACAAACGGAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCg > 1:518179/1‑251 (MQ=255) ttACAAACGGAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTaa > 1:223951/1‑251 (MQ=255) aaaCGGAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAacac < 1:893922/251‑1 (MQ=255) gAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAac > 1:893675/1‑244 (MQ=255) gAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGt > 1:736312/1‑251 (MQ=255) aTTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTg < 1:49402/250‑1 (MQ=255) ttACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGaa < 1:872496/251‑1 (MQ=255) aCCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACAAATGGTGAAAg > 1:548844/1‑251 (MQ=255) gagaCAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCtt > 1:901130/1‑251 (MQ=255) agaCAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGcc < 1:558837/248‑1 (MQ=255) aTACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGcc < 1:715696/198‑1 (MQ=255) aCGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGagg > 1:846888/1‑251 (MQ=255) cgcgGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGaggc < 1:392058/251‑1 (MQ=255) aCCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAacac < 1:457519/222‑1 (MQ=255) aCCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCAt > 1:617477/1‑251 (MQ=255) ccTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCAtt > 1:3399/1‑251 (MQ=255) cAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGgtgt < 1:806983/250‑1 (MQ=255) cGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAAc < 1:711787/251‑1 (MQ=255) cGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAAc < 1:835070/251‑1 (MQ=255) cGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAAc < 1:99674/251‑1 (MQ=255) cGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAAc < 1:148950/251‑1 (MQ=255) gTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATgg > 1:610729/1‑161 (MQ=255) aGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAAt > 1:119004/1‑251 (MQ=255) gTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATa > 1:847185/1‑250 (MQ=255) gCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCaa > 1:325253/1‑250 (MQ=255) cAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAAc < 1:869430/250‑1 (MQ=255) gTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCtt > 1:64895/1‑251 (MQ=255) ttgttgCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTc < 1:401907/250‑1 (MQ=255) ttgttgCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTc < 1:298114/250‑1 (MQ=255) cccGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAAc < 1:696148/236‑1 (MQ=255) tAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCAt < 1:243425/250‑1 (MQ=255) aTTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATtgat < 1:603417/251‑1 (MQ=255) gTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAAc < 1:860182/189‑1 (MQ=255) gTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGaaa > 1:413659/1‑250 (MQ=255) gTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGaaa > 1:268109/1‑250 (MQ=255) aaCCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCtattat < 1:108637/251‑1 (MQ=255) aCCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTattatt > 1:544510/1‑251 (MQ=255) cACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCa < 1:316305/179‑1 (MQ=255) caacaaAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAatat < 1:103556/86‑1 (MQ=255) caacaaAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATAcggc > 1:805337/1‑179 (MQ=255) caacaaAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGc > 1:226879/1‑244 (MQ=255) caacaaAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAAccc > 1:16502/1‑250 (MQ=255) caaAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGaggcaggc < 1:868117/138‑1 (MQ=255) aaaGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATgg > 1:659794/1‑84 (MQ=255) aaaGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAg > 1:514338/1‑144 (MQ=255) aaaGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGAc > 1:791816/1‑155 (MQ=255) aaaGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCaa > 1:179254/1‑251 (MQ=255) aaGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAg < 1:628423/251‑1 (MQ=255) gagGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAAc > 1:730934/1‑164 (MQ=255) gggTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCTGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGa > 1:118606/1‑251 (MQ=255) gggTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGa > 1:129737/1‑251 (MQ=255) tATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAatat < 1:758256/251‑1 (MQ=255) aTCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAAt > 1:484486/1‑170 (MQ=255) cAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGaa > 1:406271/1‑105 (MQ=255) cAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAAc > 1:426746/1‑154 (MQ=255) cAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTaa > 1:858197/1‑251 (MQ=255) attattGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAAc < 1:279635/251‑1 (MQ=255) attattGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAAc < 1:385052/251‑1 (MQ=255) ttGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAACTGGa > 1:492776/1‑251 (MQ=255) ggTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATgg < 1:232000/61‑1 (MQ=255) ggTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAACTGGACCgg > 1:726113/1‑251 (MQ=255) gTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAAccc < 1:312468/222‑1 (MQ=255) ccGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATAtt > 1:72488/1‑229 (MQ=255) tGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCGATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAAc < 1:876882/224‑1 (MQ=255) aCCGAAATATTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAACTGGACCGGTTGCGGCAATATGCTGAATTTGTCCAATcaca > 1:646628/1‑251 (MQ=255) atatTGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAACTGGACCGGTTGCGGCAATATGCTGAATTTGTCCAATCACATTAcc > 1:218191/1‑250 (MQ=255) ttGCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAACTGGACCGGTTGCGGCAATATGCTGAATTTGTCCAATCACATTACCCGTc < 1:884222/251‑1 (MQ=255) gCTCACAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAACTGGACCGGTTGCGGCAATATGCTGAATTTGTCCAATCACATTACCCGTCg > 1:29393/1‑250 (MQ=255) | GTTGAGTGTGAAAGGTTTTACCAAATTACAAACGGAATTACCAGAGACAATACGCGGCACCTATGCCGGTTTGGCACATGCGCAAACGATTGCGTATTTGAAAAAGTTAGGTATAACGGCAGTCGAGTTGTTGCCCGTAAATTACGCGGTAAGCGAACCGCACTTACAACAAAGAGGGTTATCCAATTATTGGGGTTACAACCCGTTAGCCATGTTTGCCGTGGAACCGAAATATTGCTCGCAAGCCAATATGGCGAACCCGTTAAATGAATTTAAACACATGGTGAAAGCCTTGCATGAGGCAGGCATTGAAGTGATTTTAGACGTGGTGTTCAACCATACGGCGGAATCGGAAAAATACTTCCCAACCTTTAGTCAACGTGGCATTGATGACGAAACCTATTATTGGCAAACCCCGCAAGACGAATATTTAAACTGGACCGGTTGCGGCAATATGCTGAATTTGTCCAATCACATTACCCGTCG > 1/2133387‑2133872 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |