| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,078,949 | A→C | intergenic (+23/+13) | unknown → / ← unknown | FIG00699498: hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,078,949 | 0 | A | C | 100.0% | 76.3 / NA | 23 | intergenic (+23/+13) | unknown/unknown | FIG00699498: hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (14/9); total (14/9) | |||||||||||
GTTTAACTTCGGGTATTTTAAGAAAAAATCTCTGTAATTTTTACAGAATCAAAATTGATAACGCTACGCCAATTTTGCACACCGAATTTTTAAATATTAGATTTGTTGAAGACGGACGCAAAGATAGCGTAGTAAAATTTGTCTCTACCCTTGCACCATCCACTCCGCCGTTTTATTGCTTATTATCTGAATTGAATGAAGAAGAATGATTAGTAAGGCTTAGCGAAAAAAATAAACCTTTATTCTATATAAAATTATACACTAAATTATCTTCATATTGCCCTTGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGTAATTCTTTGGGCGCCATCAAATGCCTGCCAGTTATTGACTTTATCTTCACACATATACTCAATAAACCGCACGAACTCGCTTTTTGTCGATGAGAAGAAGATATACGGTGGTCGTGTAATGTTAATTAAGCGTAGGAAGTCGATAAGATCGAAATAATGCGCTTGCTT > 1/2078718‑2079195 | gTTTAACTTCGGGTATTTTAAGAAAAAATCTCTGTAATTTTTACAGAATCAAAATTGATAACGCTACGCCAATTTTGCACACCGAATTTTTAAATATTAGATTTGTTGAAGACGGACGCAAAGATAGCGTAGTAAAATTTGTCTCTACCCTTGCACCATCCACTCCGCCGTTTTATTGCTTATTATCTGAATTGAATGAAGAAGAATGATTAGTAAGGCTTAGCGAAAAAACTAAACCTTTATTCtatat < 1:13785/250‑1 (MQ=255) 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1:369672/160‑1 (MQ=255) gaaTGATTAGTAAGGCTTAGCGAAAAAACTAAACCTTTATTCTATATAAAATTATACACTAAATTATCTTCATATTGCCCTTGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGTAATTCTTTGGGCGCCATCAAATGCCTGCCAGTTATTGACTTTATCTTCACACATATACTCAATAAACCGCACGAACTCGCTTTTTGTCGATGAGAAGAAGATATACGGTGGTCGTGTAATGTTAATTAAGCGTAGGAAGTCGAt > 1:176548/1‑251 (MQ=255) tAGTAAGGCTTAGCGAAAAAACTAAACCTTTATTc > 1:875220/1‑35 (MQ=255) tAGTAAGGCTTAGCGAAAAAACTAAACCTTTATTCTATATAAAATTATACACTAAATTATCTTCATATTGCCCTTGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGTAATTCTTTGGGCGCCATCAAATGCCTGCCAGTTATTGACTTTATCTTCACACATATACTCAATAAACCGCACGAACTCGCTTTTTGTCGATGAGAAGAAGATATACGGTGGTCGTGTAATGTTAATTAAGCGTAGGAAGTCGATAAGATCg > 1:341428/1‑251 (MQ=255) aaaacTAAACCTTTATTCTATATAAAATTATACACTAAATTATCTTCATATTGCCCTTGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGTAATTCTTTGGGCGCCATCAAATGCCTGCCAGTTATTGACTTTATCTTCACACATATACTCAATAAACCGCACGAACTCGCTTTTTGTCGATGAGAAGAAGATATACGGTGGTCGTGTAATGTTAATTAAGCGTAGGAAGTCGATAAGATCGAAATAATGCgcttgctt < 1:285180/251‑1 (MQ=255) | GTTTAACTTCGGGTATTTTAAGAAAAAATCTCTGTAATTTTTACAGAATCAAAATTGATAACGCTACGCCAATTTTGCACACCGAATTTTTAAATATTAGATTTGTTGAAGACGGACGCAAAGATAGCGTAGTAAAATTTGTCTCTACCCTTGCACCATCCACTCCGCCGTTTTATTGCTTATTATCTGAATTGAATGAAGAAGAATGATTAGTAAGGCTTAGCGAAAAAAATAAACCTTTATTCTATATAAAATTATACACTAAATTATCTTCATATTGCCCTTGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGTAATTCTTTGGGCGCCATCAAATGCCTGCCAGTTATTGACTTTATCTTCACACATATACTCAATAAACCGCACGAACTCGCTTTTTGTCGATGAGAAGAAGATATACGGTGGTCGTGTAATGTTAATTAAGCGTAGGAAGTCGATAAGATCGAAATAATGCGCTTGCTT > 1/2078718‑2079195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |