| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,075,647 | T→C | P104P (CCA→CCG) | unknown ← | Homoserine O‑acetyltransferase (EC 2.3.1.31) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,075,647 | 0 | T | C | 100.0% | 200.9 / NA | 60 | P104P (CCA→CCG) | unknown | Homoserine O‑acetyltransferase (EC 2.3.1.31) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (27/33); total (27/33) | |||||||||||
ACGTGATTAAAACCGATGGCTTCCGCGCTCAAGGAAAGGGAAGAGCATAGATTAACCACATTGGAGACGAAATCGGGATAATCAATCGCCCATTGGG‑TT‑GCCTGCATACCGCC‑AAAGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGTGGATTAATTGAGGACGGACCGGTCGTGCCTTTGCAGCCGCCAAGTACGTTGGAACAAATAAAAAAATAGCGGGAAGTGTCCAATGCTAAGCCATCGCCCATAAAATTTTGCCACCAGCCTTCTTGGTTTGTGCTTTTATCAAAATAAGGTTCGGCGTCGCCGGTAAGCGCGTGGCAGATTAACACCGCATTGCTTTTATCCGCATTCAATTCACCATAGGTTTGATAAGCCACGTCAATTTGTTG > 1/2075408‑2075892 | acgttataaaaaCCGATGGCTCCCGCGCTCAAGGAAAGGGAAGAGCATAGATTACCCACTTGGGAGACGAAATGGGAATAATCAATCGCCCTTGGGG‑TT‑GCCTGCATCCCGCA‑AAGGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTg < 1:321931/242‑1 (MQ=255) 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cATACCGCC‑AAAGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTGAGGACGGACCGGTCGTGCCTTTGCAGCCGCCAAGTACGTTGGAACAAATAAAAAAATAGCGGGAAGTGTCCAATGCTAAGCCATCGCCCATAAAATTTTGccac > 1:693535/1‑250 (MQ=255) aaGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTGAGGACGGACCGGTCGTGCCTTTGCAGCCGCCAAGTACGTTGGAACAAATAAAAAAATAGCGGGAAGTGTCCAATGCTAAGCCATCGCCCATAAAATTTTGCCACCAGCCTTCTTg < 1:134003/251‑1 (MQ=255) aGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGCGGATTAATTGAGGACGGACCGGTCGTGCCTTTGCAGCCGCCAAGTACGTTGGAACAAATAAAAAAATAGCGGGAAGTGTCCAATGCTAAGCCATCGCCCATAAAATTTTGCCACCAGCCTTCTTgg > 1:799733/1‑251 (MQ=255) 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ACGTGATTAAAACCGATGGCTTCCGCGCTCAAGGAAAGGGAAGAGCATAGATTAACCACATTGGAGACGAAATCGGGATAATCAATCGCCCATTGGG‑TT‑GCCTGCATACCGCC‑AAAGG‑AACCGCCGATAATGGCGTGTAAATGCGGAATTTCAAGAAAATCCAGCAGCGCTTTTTGCACTTTGATGATGTCTTGCACGATAACCGCGGGAAATTGGCTGCCGTAAGGGCGATTGGTTTGTGGATTAATTGAGGACGGACCGGTCGTGCCTTTGCAGCCGCCAAGTACGTTGGAACAAATAAAAAAATAGCGGGAAGTGTCCAATGCTAAGCCATCGCCCATAAAATTTTGCCACCAGCCTTCTTGGTTTGTGCTTTTATCAAAATAAGGTTCGGCGTCGCCGGTAAGCGCGTGGCAGATTAACACCGCATTGCTTTTATCCGCATTCAATTCACCATAGGTTTGATAAGCCACGTCAATTTGTTG > 1/2075408‑2075892 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |