| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,959,453 | A→G | T34A (ACC→GCC) | unknown → | CRISPR‑associated protein Cas5 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,959,453 | 0 | A | G | 100.0% | 286.8 / NA | 87 | T34A (ACC→GCC) | unknown | CRISPR‑associated protein Cas5 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (49/38); total (49/38) | |||||||||||
TTTCTCCAGAGCGGGCTTATTGGTGCTGGATAACGGACATTATCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCACCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGCCAGCAGCGCGCTTCAATGTTGCTCAAAGATGTGGCTTATCG > 1/1959220‑1959694 | tttCTCCAGAGCGGGCTTATTGGTGCTGGATAACGGACATTATCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATg > 1:303540/1‑251 (MQ=255) ccAGAGCGGGCTTATTGGTGCTGGATAACGGACATTATCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGTACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGat < 1:471285/251‑1 (MQ=255) ggCTTATTGGTGCTGGATAACGGACATTATCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGa > 1:629895/1‑251 (MQ=255) tATTGGTGCTGGATAACGGACATTATCATGATGTGCTTGGTGCAGCTTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGc > 1:846976/1‑250 (MQ=255) gTGCTGGATAACGGACATTATCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGa > 1:684206/1‑251 (MQ=255) aTAACGGACATTATCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCg > 1:318156/1‑248 (MQ=255) ttATCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGaa > 1:434412/1‑226 (MQ=255) aTCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTgg > 1:889536/1‑222 (MQ=255) aTCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTga > 1:65536/1‑251 (MQ=255) aTCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTga > 1:847262/1‑251 (MQ=255) aTCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTga > 1:812787/1‑251 (MQ=255) tCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTgag < 1:126092/251‑1 (MQ=255) tCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTgag < 1:458866/251‑1 (MQ=255) tCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTgag < 1:280807/251‑1 (MQ=255) atgatgTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGAt < 1:396598/251‑1 (MQ=255) tgtgCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGaa > 1:521690/1‑251 (MQ=255) gtgCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGaaa > 1:332649/1‑251 (MQ=255) gTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTaaa > 1:209210/1‑251 (MQ=255) gTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTaaa > 1:873200/1‑251 (MQ=255) gATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGa > 1:795162/1‑251 (MQ=255) gatgatgatACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAAt > 1:74137/1‑251 (MQ=255) tgatgatACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATgg < 1:497038/251‑1 (MQ=255) atgatACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAatat > 1:280266/1‑173 (MQ=255) atgatACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGAt > 1:262199/1‑251 (MQ=255) atACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATtg > 1:569338/1‑186 (MQ=255) atACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTaa > 1:258167/1‑251 (MQ=255) aCTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATg < 1:289981/251‑1 (MQ=255) aCTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATg < 1:225399/251‑1 (MQ=255) cTGTTGTTCCGCCTGAAGAATTCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGcc < 1:436020/191‑1 (MQ=255) cTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGt > 1:898449/1‑251 (MQ=255) aagaaTCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAAt < 1:203636/250‑1 (MQ=255) gaaTCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAg > 1:335226/1‑251 (MQ=255) aTCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGgt < 1:25182/251‑1 (MQ=255) ccGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGgtag < 1:277900/251‑1 (MQ=255) ttttATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACTGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTaa < 1:262437/251‑1 (MQ=255) ttttATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTaa < 1:701942/251‑1 (MQ=255) ttttATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTaa < 1:361209/251‑1 (MQ=255) tataAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGgt > 1:142135/1‑243 (MQ=255) aacaacGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAag < 1:40979/251‑1 (MQ=255) tAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGAt > 1:10639/1‑178 (MQ=255) tAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGt > 1:97885/1‑211 (MQ=255) aaGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGt < 1:530588/251‑1 (MQ=255) gCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAAt > 1:346545/1‑243 (MQ=255) cAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTc > 1:475835/1‑200 (MQ=255) cAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAAt > 1:145953/1‑242 (MQ=255) cAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATAc < 1:252290/250‑1 (MQ=255) aaTATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACAt < 1:420693/251‑1 (MQ=255) aaTATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACAt < 1:316034/251‑1 (MQ=255) ttATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAgatg > 1:61214/1‑246 (MQ=255) aTTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAg > 1:288543/1‑251 (MQ=255) aaTCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTta < 1:531261/226‑1 (MQ=255) aaTCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATAc < 1:732130/229‑1 (MQ=255) gtggtgAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAAc > 1:581241/1‑153 (MQ=255) gtggtgAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATg > 1:603401/1‑171 (MQ=255) gtggtgAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTc > 1:861203/1‑174 (MQ=255) gtggtgAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGgt < 1:203699/191‑1 (MQ=255) gtggtgAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATAc < 1:231276/224‑1 (MQ=255) gtggtgAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATAc > 1:710161/1‑224 (MQ=255) ggtgAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAAt > 1:312953/1‑250 (MQ=255) ggTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAAt > 1:552141/1‑206 (MQ=255) gtgCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATgg < 1:767104/151‑1 (MQ=255) tgCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATg > 1:738029/1‑203 (MQ=255) gCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAGTTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTaaa > 1:665503/1‑251 (MQ=255) gCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTta < 1:278021/206‑1 (MQ=255) gCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATAc < 1:146646/209‑1 (MQ=255) cTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAAc < 1:89971/251‑1 (MQ=255) ccgacccgaACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGc < 1:588540/251‑1 (MQ=255) gacccgaACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGt > 1:296712/1‑148 (MQ=255) aaCTCAAAGTGGAACGTGTCGGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGcc < 1:776478/82‑1 (MQ=255) aaCTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAagag > 1:848243/1‑177 (MQ=255) aCGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGcc > 1:552662/1‑236 (MQ=255) cGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAagag > 1:211176/1‑163 (MQ=255) gtgtCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAAc > 1:224026/1‑222 (MQ=255) gtgtCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGCcagcag > 1:835677/1‑239 (MQ=255) tgtCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGa < 1:675299/130‑1 (MQ=255) tgtCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAga > 1:126618/1‑183 (MQ=255) tgtCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGCCAGCAGCGCGCTTCAATGt < 1:735875/251‑1 (MQ=255) tgtCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGCCAGCAGCGCGCTTCAATGt < 1:462110/251‑1 (MQ=255) ggTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGcc < 1:346196/54‑1 (MQ=255) ggTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGCCAGCAGCGCGCTTCAATGTTGCTCAAAGAtg > 1:504389/1‑251 (MQ=255) gTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGAt < 1:665717/35‑1 (MQ=255) gTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAaga > 1:384004/1‑147 (MQ=255) gTTATTACACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACAt < 1:299149/167‑1 (MQ=255) ttattaCACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGCCAGCAGCGCGCTTCAATGt > 1:573179/1‑237 (MQ=255) attaCACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGCCAGCAGCGCGCTTCAATGTTGCTCAAAGATGTgg > 1:770570/1‑250 (MQ=255) attaCACCGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATACAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGCCAGCAGCGCGCTTCAATGTTGCTCAAAGAtg < 1:420067/247‑1 (MQ=255) ccGTCTGCCGCCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAAACGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGCCAGCAGCGCGCTTCAATGTTGCTCAAAGATGTGGCTTATCg < 1:546428/251‑1 (MQ=255) | TTTCTCCAGAGCGGGCTTATTGGTGCTGGATAACGGACATTATCATGATGTGCTTGGTGCAGATTTTGATGATGATACTGTTGTTCCGCCTGAAGAATCCGTTTTATAAAAACAACGTAATTAAAGGAAGCAATATGAGTTTTATTCTAGAAATCAGTGGTGAACTGGTGTGCTTTACCCGACCCGAACTCAAAGTGGAACGTGTCAGCTATCCGGTTATTACACCGTCTGCCACCAGAAATATCTTGATGGCGATATTGTGGAAGCCGGCGATCCGCTGGCGCGTGTTTGAGATAGAAATCTTAAAACCGATTCAATGGATTAATGTTCGACGTAATGAATTAGGTAGTAAAGCAACAAGAGATGCTGAATGTTTATACATAGATGATTTAAGATATGATGAAAAATCAGATAGTTTTAAACTAAAGCATCGCCAGCAGCGCGCTTCAATGTTGCTCAAAGATGTGGCTTATCG > 1/1959220‑1959694 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |