| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 356,321 | T→C | intergenic (‑22/‑92) | unknown ← / → unknown | D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose 1‑phosphate adenylyltransferase (EC 2.7.7.70) / D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑7‑phosphate kinase (EC 2.7.1.167)/Lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (EC 2.3.1.241) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 356,321 | 0 | T | C | 100.0% | 191.6 / NA | 57 | intergenic (‑22/‑92) | unknown/unknown | D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose 1‑phosphate adenylyltransferase (EC 2.7.7.70) / D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑7‑phosphate kinase (EC 2.7.1.167)/Lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (EC 2.3.1.241) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (26/31); total (26/31) | |||||||||||
GTTAAGCCCAGCAATTGCACCGGCACATTTAACGAAGCGATGTTCATTGCCACGTTTGCCGCACCGCCTGCACGCTCCTCATTTTGCTGAACACGCACCACCGGCACCGGTGCTTCCGGTGAAATACGGTTGGTTGCACCGAACCAATAGCGATCCAACATCACATCGCCTAATACCAAAACTTTTGCATGATTAAATTGTGCAGAATATTGAGCCATTTGATTTTCTCTTATATAGAATAAAAAATTTCGCTAATACTACCACAGGGGAAATGCTATTTCCTAAAAATTCCGCTAAACTAAACCAATTGAAATAATCCTGTAATTCCTTTATGGCAAAATCCGTTCTTCCGACTTTTAAAACTGAATTTCTCCATCCCAAACATTGGGGCTTTTGGCTTGCACTCGGCATTTTCCGTCTGATATTACTGCTTCCTTATCCTATTTTATGCAAAATCGGACACGGATTAGGTTGGTTATTTG > 1/356082‑356563 | gTTAAGCCCAGCAATTGCACCGGCACATTTAACGAAGCGATGTTCATTGCCACGTTTGCCGCACCGCCTGCACGCTCCTCATTTTGCTGAACACGCACCACCGGCACCGGTGCTTCCGGTGAAATACGGTTGGTTGCACCGAACCAATAGCGATCCAACATCACATCGCCTAATACCAAAACTTTTGCATGATTAAATTGTGCAGAATATTGAGCCATTTGATTTTCTCTTATATAGAACAAAAAATTTCg > 1:22661/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |