| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,776,164 | G→A | I451I (ATC→ATT) | unknown ← | DNA mismatch repair protein MutL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,776,164 | 0 | G | A | 100.0% | 239.3 / NA | 71 | I451I (ATC→ATT) | unknown | DNA mismatch repair protein MutL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (34/37); total (34/37) | |||||||||||
CTTTTTGCAGCGTTATTTTATGTTGTGTCGCCTCTTCCGTAAAAGTAAAACCGATTTGCTCAAAGAACGTTTTTTGTTGTAACCATGCCTGCCATTGGTCATTAGATAAGCGAAAAATAATCGGGATTAACAATGGCTGAGATGTTGGCGCCAAGGTTAAATTCAACTCCAATTTTAAATGCTGCAAACGGGCTAATGACAACAAATAAAAATGCTGTCCTTGCTGTAACAATAATGCCTCGTCGTTGATAAGCGCAAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGCCGTCCACAAGGTTTTGTGGGCATTCAATACGTTCTGCGTAATTTGTTCACGATGGGCATTTTCACGATAAAAGTGCGGTGAACTTTGCCGGTGTTTTTGCGTGCCGTCATTCTTTTTTTCGGCGTAGGCAGTGGCGGAATAACCGGTA > 1/1775917‑1776398 | cTTTTTGCAGCGTTATTTTATGTTGTGTCGCCTCTTCCGTAAAAGTAAAACCGATTTGCTCAAAGAACGTTTTTTGTTGTAACCATGCCTGCCATTGGTCATTAGATAAGCGAAAAATAATCGGGATTAACAATGGCTGAGATGTTGGCGCCAAGGTTAAATTCAACTCCAATTTTAAATGCTGCAAACGGGCTAATGACAACAAATAAAAATGCTGTCCTTGCTGTAACAATAATGCCTCGTCGTTAATa < 1:499082/251‑1 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gTCCTTGCTGTAACAATAATGCCTCGTCGTTAATAAGCGCAAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGCCGTCCACAAGGTTTTGTGGGCATTCAATACGTTCTGCGTAATTTGTTCACGATGGGCATTTTCACGATAAAAGTGCGGTGAACTTTGCCGGTGTTTTTGCg > 1:556033/1‑219 (MQ=255) gCTGTAACAATAATGCCTCGTCGTTAATAAGCGCAAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGCCGTCCACAAGGTTTTGTGGGCATTCAATACGTTc < 1:605858/146‑1 (MQ=255) aaCAATAATGCCTCGTCGTTAATAAGCGCAAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGCCGTCCACAAGGTTTTGTGGGCATTCAATACGTTCTGCGTAATTTGTTCACGATGGGCATTTTCACGATAAAAGTGCGGTGAACTTTGCCGGTGTTTTTGCGTGCCGTCATTCTTTTTTTCGGCGTAGGc > 1:853309/1‑236 (MQ=255) cAATAATGCCTCGTCGTTAATAAGCGCAAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGc < 1:828896/105‑1 (MQ=255) cAATAATGCCTCGTCGTTAATAAGCGCAAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGCCGTCCACAAGGTTTTGTGGGCATTCAATACGTTCTGCGTAATTTGTTCACGATGGGCATTTTCACGATAAAAGTGCGGTGAACTTTGCCGGTGTTTTTGCGTGCCGTCATTCTTTTTTTCGGCGTAGGCAGTGGCGGAATAACCg > 1:815034/1‑250 (MQ=255) ataatGCCTCGTCGTTAATAAGCGCAAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGCCGTCCACAAGGTTTTGTGGGCATTCAATACGTTCTGCGTAATTTGTTCACGATGGGCATTTTCACGATAAAAGTGCGGTGAACTTTGCCGGTGTTTTTGCGTGCCGTCATTCTTTTTTTCGGCGTAGGCAGTGGCGGAATAACCGGTa > 1:651429/1‑251 (MQ=255) tcgtTAATAAGCGCGAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGCAGTCCACAAGGt < 1:453867/104‑1 (MQ=255) tcgtTAATAAGCGCAAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGCCGTCCACAAGGTTTTGTggg > 1:173865/1‑112 (MQ=255) tcgtTAATAAGCGCAAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGCCGTCCACAAGGTTTTGTGGGCATTCAATACGTTCTGCGTAATTTGTTCACGATGGGCATTTTCACGATAAAAGTGCGGTGAACTTTGCCGGTGTTTTTGCGTGCCGTCATTCTTTTTTTCGGCGTAGGCAGTGGCGGaa > 1:206710/1‑231 (MQ=255) | CTTTTTGCAGCGTTATTTTATGTTGTGTCGCCTCTTCCGTAAAAGTAAAACCGATTTGCTCAAAGAACGTTTTTTGTTGTAACCATGCCTGCCATTGGTCATTAGATAAGCGAAAAATAATCGGGATTAACAATGGCTGAGATGTTGGCGCCAAGGTTAAATTCAACTCCAATTTTAAATGCTGCAAACGGGCTAATGACAACAAATAAAAATGCTGTCCTTGCTGTAACAATAATGCCTCGTCGTTGATAAGCGCAAGCGCGTGTAAAAAATCGGTATTGGGTTTGCTGACTTCCGCTATGGTCATTTCCGTTTGAGGCTGATTTTTTAACGCCGTCCACAAGGTTTTGTGGGCATTCAATACGTTCTGCGTAATTTGTTCACGATGGGCATTTTCACGATAAAAGTGCGGTGAACTTTGCCGGTGTTTTTGCGTGCCGTCATTCTTTTTTTCGGCGTAGGCAGTGGCGGAATAACCGGTA > 1/1775917‑1776398 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |