| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,714,815 | C→A | E245* (GAG→TAG) | unknown ← | DNA topoisomerase III (EC 5.99.1.2) in PFGI‑1‑like cluster |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,714,815 | 0 | C | A | 100.0% | 171.9 / NA | 51 | E245* (GAG→TAG) | unknown | DNA topoisomerase III (EC 5.99.1.2) in PFGI‑1‑like cluster |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (24/27); total (24/27) | |||||||||||
GTTCTAGGGTAGGTTGTTGCTTTGTGGGTTTCGTATAAGGATTGAGCAATATCTAATACCTGCTGAGCGCCTAATCCGTACAAACGGTTTGCTTCACTTTGTAAATCGCTTAGTGCAAATAGCAGCGGGGCACTTTGTTTCTCCCGCTTGGTCTCTACTGACTCCACTTTCATTACGCCGGCTTGTTGCACTTGTTGATTCACTGCTTGTATCGTTTGTTGGGATAAACAGAGTCCGTCCTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCC > 1/1714574‑1715059 | gTTCTAGGGTAGGTTGTTGCTTTGTGGGTTTCGTATAAGGATTGAGCAATATCTAATACCTGCTGAGCGCCTAATCCGTACAAACGGTTTGCTTCACTTTGTAAATCGCTTAGTGCAAATAGCAGCGGGGCACTTTGTTTCTCCCGCTTGGTCTCTACTGACTCCACTTTCATTACGCCGGCTTGTTGCACTTGTTGATTCACTGCTTGTATCGTTTGTTGGGATAAACAGAGTCCGTCCTAATCACAgtg > 1:363102/1‑251 (MQ=255) 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1:641906/155‑1 (MQ=255) gTGCAAATAGCAGCGGGGCACTTTGTTTCTCCCGCTTGGTCTCTACTGACTCCACTTTCATTACGCCGGCTTGTTGCACTTGTTGATTCACTGCTTGTATCGTTTGTTGGGATAAACAGAGTCCGTCCTAATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTg > 1:263584/1‑251 (MQ=255) gCAAATAGCAGCGGGGCACTTTGTTTCTCCCGCTTGGTCTCTACTGACTCCACTTTCATTACGCCGGCTTGTTGCACTTGTTGATTCACTGCTTGTATCGTTTGTTGGGATAAACAGAGTCCGTCCTAATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTaa > 1:684264/1‑166 (MQ=255) aaaTAGCAGCGGGGCACTTTGTTTCTCCCGCTTGGTCTCTACTGACTCCACTTTCATTACGCCGGCTTGTTGCACTTGTTGATTCACTGCTTGTATCGTTTGTTGGGATAAACAGAGTCCGTCCTAATCACAg < 1:458522/133‑1 (MQ=255) ttGTTTCTCCCGCTTGGTCTCTACTGACTCCACTTTCATTACGCCGGCTTGTTGCACTTGTTGATTCACTGCTTGTATCGTTTGTTGGGATAAACAGAGTCCGTCCTAATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTCGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGAc < 1:229300/251‑1 (MQ=255) 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GTTCTAGGGTAGGTTGTTGCTTTGTGGGTTTCGTATAAGGATTGAGCAATATCTAATACCTGCTGAGCGCCTAATCCGTACAAACGGTTTGCTTCACTTTGTAAATCGCTTAGTGCAAATAGCAGCGGGGCACTTTGTTTCTCCCGCTTGGTCTCTACTGACTCCACTTTCATTACGCCGGCTTGTTGCACTTGTTGATTCACTGCTTGTATCGTTTGTTGGGATAAACAGAGTCCGTCCTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCC > 1/1714574‑1715059 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |