| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,456,758 | A→T | I162I (ATA→ATT) | unknown → | ParA‑like protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,456,758 | 0 | A | T | 98.1% | 176.1 / ‑4.1 | 53 | I162I (ATA→ATT) | unknown | ParA‑like protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (30/22); minor base C (1/0); total (31/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.76e-01 | |||||||||||
TGGTGCGCCACGTATTGAAAAAGCCATGACCGATTCGATTAAACTTGCCGATTACATTCTGATTCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCAATTGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCCGGGTTAGTCATCAGTCAAACGAATAAGAAGACAAATTTAGCTAAAGAAGTTATTTCGTTTATCAACGAAAACTTTGAAATACCGTTATTAAAGGGTAGTACGGCGGTACGCGTCAGCTATGCAGAAGTCTTAAGTTCCGGTAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGCACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGTACACTAAGCAAATCCGGGCTTTCTATGGGTAGCATTGAAAAAACGGCTATGCCACAGCTCAAAGA > 1/1456521‑1456992 | tggagctccccgcaTTGAAAAAGCCATGACCGATTCGATTAAACTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGttattagaag < 1:454616/238‑5 (MQ=255) agctccccgcaTTGAAAAAGCCATGACCGATTCGATTAAACTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGttattagaaggc < 1:756345/240‑7 (MQ=255) ccccgcaTTGAAAAAGCCATGACCGATTCGATTAAACTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGttattagaaggcagtac < 1:423631/245‑12 (MQ=255) ccccgcaTTGAAAAAGCCATGACCGATTCGATTAAACTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGttattagaaggcagtac < 1:806558/245‑12 (MQ=255) gCCATGACCGATTCGATTAAACTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAg > 1:227459/1‑251 (MQ=255) aTGACCGATTCGATTAAACTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTa < 1:542422/251‑1 (MQ=255) aTGACCGATTCGATTAAACTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTa < 1:480745/251‑1 (MQ=255) tGACCGATTCGATTAAACTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGttattagaaggc > 1:675372/1‑221 (MQ=255) gattAAACTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCt > 1:397924/1‑239 (MQ=255) aaCTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGttattagaaggcagtacaacgg < 1:735347/222‑17 (MQ=255) cTTGCCGATTACATTCTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAgctc < 1:85244/251‑4 (MQ=255) cTGATCCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGtttt > 1:177639/1‑251 (MQ=255) aaCCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGttattagaaggc > 1:291841/1‑176 (MQ=255) tCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAaaga < 1:590249/251‑1 (MQ=255) tCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAaaga < 1:683301/251‑1 (MQ=255) aTTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGttattagaaagc > 1:437352/1‑166 (MQ=255) aTTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAAGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGa > 1:425982/1‑251 (MQ=255) atatTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGc < 1:546383/250‑1 (MQ=255) atatTTGGGCATGCAAAGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCa > 1:404339/1‑251 (MQ=255) aGATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAaaga > 1:49132/1‑225 (MQ=255) gattcgatagcgCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTaatcaaatca > 1:740660/12‑250 (MQ=255) gATTCGATAGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAgc > 1:33978/1‑188 (MQ=255) cgatagAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAaaga < 1:242778/215‑1 (MQ=255) gAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAAt > 1:237924/1‑251 (MQ=255) ggTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCg < 1:662222/214‑1 (MQ=255) tGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAAc < 1:8772/250‑1 (MQ=255) gCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAgc < 1:620220/168‑2 (MQ=255) cACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTa < 1:525285/251‑1 (MQ=255) cGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAgg > 1:200031/1‑251 (MQ=255) tATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGa < 1:96834/250‑1 (MQ=255) aaaTTAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCaa > 1:47557/1‑251 (MQ=255) ttAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAAGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAatat < 1:299934/251‑1 (MQ=255) ttAATGATAAGCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTAGTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAatat < 1:430768/251‑1 (MQ=255) gCTCAAAGCGGGTTTAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGa > 1:530502/1‑232 (MQ=255) ggtttAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAaaga > 1:351420/4‑170 (MQ=255) ggtttAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAggca > 1:703895/4‑249 (MQ=255) ggtttAGTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAggca > 1:50307/4‑249 (MQ=255) gTCATCAGTCAAACAAATAAACAAACCAATTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTaa > 1:674597/1‑251 (MQ=255) tcaaacaaataaacaaaccaaTTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTAAGCAAATcc < 1:335871/232‑1 (MQ=255) caaataaacaaaccaaTTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAgg > 1:471212/15‑202 (MQ=255) caaataaacaaaccaaTTTAGCAAAAGATGTTATTGAGTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTAAGCAAATCCggg > 1:334441/15‑249 (MQ=255) agatgttattgagTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAaaga > 1:381207/13‑126 (MQ=255) atgttattgagTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAg > 1:587947/11‑177 (MQ=255) atgttattgagTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTAAGCAAATCCGGGCTTTCTATGGGTAGCATTGAAAAAAcag > 1:508724/11‑248 (MQ=255) atgttattgagTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTAAGCAAATCCGGGCTTTCTATGGGTAGCATTGAAAAAAcag > 1:666918/11‑248 (MQ=255) atgttattgagTTTATTAAAGATAACTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGGATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTAAGCAAATCCGGGCTTTCTATGGGTAGCATTGAAAAAAcagc < 1:438021/241‑4 (MQ=255) gttattgagTTTATTAAAGATAACTTTGAAATCCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTAAGCAAATCCGGGCTTTCTATGGGTAGCATTGAAAAAACAGCTa > 1:551538/9‑251 (MQ=255) attaaagataaCTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTaaa > 1:517246/10‑178 (MQ=255) attaaagataaCTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTAAGCAAATCCGGGCTTTCTATGGGTAGCATTGAAAAAACAGCTATGCCACAGCTCa > 1:585959/10‑251 (MQ=255) aaagataaCTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAaaga > 1:58835/7‑107 (MQ=255) aaagataaCTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTAAGCAAATCCGGGCTTTCTATggg > 1:653384/7‑216 (MQ=255) aagataaCTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTAAGCAAATCCGGGCTTTCTATGGGTAGCATTGAAAAAACAGCTATGCCACAGCTCAAaga < 1:334682/246‑1 (MQ=255) cTTTGAAATTCCGTTATTAGAAGGCAGTACAACGGTTCGCGTCAGCTATGCCGAAGTATTAAGCTCCGGCAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGTACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGCACACTAAGCAAATCCGGGCTTTCTATGGGTAGCATTGAAAAAAc > 1:835765/1‑223 (MQ=255) | TGGTGCGCCACGTATTGAAAAAGCCATGACCGATTCGATTAAACTTGCCGATTACATTCTGATTCCACTGAAACCATCACAATTTGATATTTGGGCATGCAAAGATTCAATTGAGCTGGTGCAAGCACGTATGCAAATTAATGATAAGCTCAAAGCCGGGTTAGTCATCAGTCAAACGAATAAGAAGACAAATTTAGCTAAAGAAGTTATTTCGTTTATCAACGAAAACTTTGAAATACCGTTATTAAAGGGTAGTACGGCGGTACGCGTCAGCTATGCAGAAGTCTTAAGTTCCGGTAATACGGTTTTTGAAAGTCAGTCTAAAGAAGCGAAAGCAGAGATTAATCAAATCACAAATGAAATTTTAACTGCACTAGGAGTTCAATATGAGTAAATTAACAAAAGGTACACTAAGCAAATCCGGGCTTTCTATGGGTAGCATTGAAAAAACGGCTATGCCACAGCTCAAAGA > 1/1456521‑1456992 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |