| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 271,869 | C→T | A66V (GCG→GTG) | unknown → | PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific IIC component / PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific IIB component (EC 2.7.1.193) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 271,869 | 0 | C | T | 100.0% | 221.4 / NA | 65 | A66V (GCG→GTG) | unknown | PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific IIC component / PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific IIB component (EC 2.7.1.193) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (38/27); total (38/27) | |||||||||||
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atcGATAACATGGGCTTATTATTCGCCGTGGGCGTAGCATTCGGGTTGTCCAAAGACAAGCACGGTTCTGCTGCGCTTTCCGGTTTAGTGGGCTATTATGTGGTCACTACCCTACTCGCCCCTGGCGGCGTAGCGCAATTACAACATATTGATCCAAGCCAG‑‑GTGCCTGCTGCTTTCGGCAAAATCAACAACCAATTTATCGGTATTTTAATCGGTGTACTTTCCGCCGAACTTTACAACCGTTTTTACCa > 1:731122/1‑251 (MQ=255) tAACATGGGCTTATTATTCGCCGTGGGCGTAGCATTCGGGTTGTCCAAAGACAAGCACGGTTCTGCTGCGCTTTCCGGTTTAGTGGGCTATTATGTGGTCACTACCCTACTCGCCCCTGGCGGCGTAGCGCAATTACAACATATTGATCCAAGCCAG‑‑GTGCCTGCTGCTTTCGGCAAAATCAACAACCAATTTATCGGTATTTTAATc > 1:705706/1‑208 (MQ=255) ggCTTATTATTCGCCGTGGGCGTAGCATTCGGGTTGTCCAAAGACAAGCACGGTTCTGCTGCGCTTTCCGGTTTAGTGGGCTATTATGTGGTCACTACCCTACTCGCCCCTGGCGGCGTAGCGCAATTacaaca > 1:561446/1‑134 (MQ=255) ggCTTATTATTCGCCGTGGGCGTAGCATTCGGGTTGTCCAAAGACAAGCACGGTTCTGCTGCGCTTTCCGGTTTAGTGGGCTATTATGTGGTCACTACCCTACTCGCCCCTGGCGGCGTAGCGCAATTACAACATATTGATCCAAGCCAG‑‑GTg < 1:845906/153‑1 (MQ=255) ggCTTATTATTCGCCGTGGGCGTAGCATTCGGGTTGTCCAAAGACAAGCACGGTTCTGCTGCGCTTTCCGGTTTAGTGGGCTATTATGTGGTCACTACCCTACTCGCCCCTGGCGGCGTAGCGCAATTACAACATATTGATCCAAGCCAG‑‑GTGCCTGCTGCTTTCGGCAAAATCAACAACCAATTTATCGGTATTTTAATCGGTGTACTTTCCGCCGAACTTTACAACCGTTTTTACCAAGTGGAATTGc > 1:561923/1‑250 (MQ=255) ggCTTATTATTCGCCGTGGGCGTAGCATTCGGGTTGTCCAAAGACAAGCACGGTTCTGCTGCGCTTTCCGGTTTAGTGGGCTATTATGTGGTCACTACCCTACTCGCCCCTGGCGGCGTAGCGCAATTACAACATATTGATCCAAGCCAG‑‑GTGCCTGCTGCTTTCGGCAAAATCAACAACCAATTTATCGGTATTTTAATCGGTGTACTTTCCGCCGAACTTTACAACCGTTTTTACCAAGTGGAATTGc > 1:861459/1‑250 (MQ=255) gCTTATTATTCGCCGTGGGCGTAGCATTCGGGTTGTCCAAAGACAAGCACGGTTCTGCTGCGCTTTCCGGTTTAGTGGGCTATTATGTGGTCACTACCCTACTCGCCCCTGGCGGCGTAGCGCAATTACAACATATTGATCCAAGCCAG‑‑GTGCCTGCTGCTTTCGGCAAAATCAACAACCAATTTATCGGTATTTTAATCGGTGTACTTTCCGCCGAACTTTACAACCGttt < 1:576879/232‑1 (MQ=255) cgccgtGGGCGTAGCATTCGGGTTGTCCAAAGACAAGCACGGTTCTGCTGCGCTTTCCGGTTTAGTGGGCTATTATGTGGTCACTACCCTACTCGCCCCTGGCGGCGTAGCGCAATTACAACATATTGATc > 1:584842/1‑131 (MQ=255) cgccgtGGGCGTAGCATTCGGGTTGTCCAAAGACAAGCACGGTTCTGCTGCGCTTTCCGGTTTAGTGGGCTATTATGTGGTCACTACCCTACTCGCCCCTGGCGGCGTAGCGCAATTACAACATATTGATCCAAGCCAG‑‑GTGCCTGCTGCtt < 1:27034/152‑1 (MQ=255) | AAATCTTATGGAATCAAAAATAAATTAAAGGAGTTCGTATGAGTGTTTTAAGTTATGCCCAAAAAATCGGGCAAGCCTTAATGGTACCCGTTGCCGTTTTGCCGGCAGCCGCCGTATTAATGGGGATCGGCTATTGGCTTGACCCGGACGGCTGGGGCGCAAACAGCCAACTTGCCGCCTTATTAATCAAGTCCGGCGCGGCAATCATCGATAACATGGGCTTATTATTCGCCGCGGGCGTAGCATTCGGGTTGTCCAAAGACAAGCACGGTTCTGCTGCGCTTTCCGGTTTAGTGGGCTATTATGTGGTCACTACCCTACTCGCCCCTGGCGGCGTAGCGCAATTACAACATATTGATCCAAGCCAG‑‑GTGCCTGCTGCTTTCGGCAAAATCAACAACCAATTTATCGGTATTTTAATCGGTGTACTTTCCGCCGAACTTTACAACCGTTTTTACCAAGTGGAATTGC > 1/271635‑272102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |