| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 146,560 | A→G | S34G (AGT→GGT) | unknown → | Phospholipid ABC transporter substrate‑binding protein MlaD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 146,560 | 0 | A | G | 100.0% | 290.7 / NA | 86 | S34G (AGT→GGT) | unknown | Phospholipid ABC transporter substrate‑binding protein MlaD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (43/43); total (43/43) | |||||||||||
GGCTACGACTGTATTCCGACTTCGGAAGGCATCAGCAAAGCCACCACCAGAACCGTTGTACACGCGTCATTAGTAGTATTAGGTTTAGACTTCGTACTGACCGCCATCATGTTCGGTGCGAATTAATCTCTGTTTGTAAGGAAACGTTATGCGACAAACAATTAAATATGAATTTTGGGTCGGTTTATTTTTACTCCTTGGTATCGGCTCGCTTATCTTCTTAGGCTTAAAAGTGGCGAACGTGCAAAGTTTCAGTGAAGCAAAATCTTATCACGTTTATGCAACTTTCGATAATATCGGTGGACTAAAAGTACGCGCCCCGCTTAAAGTGGGCGGCGTTGTGATTGGGCGGGTATCCGAAATCACATTGGATCCGCAAACGTATTTACCGAAAGTCACCATCGCCATTAATCAGGAATACAATGAAATTCCGGAAACCAGTTCGTTATCCATCAAAACCTCCGGTTTATTGGGCGAACAATACATTGCGCTA > 1/146313‑146805 | ggCTACGACTGTATTCCGACTTCGGAAGGCATCAGCAAAGCCACCACCAGAACCGTTGTACACGCGTCATTAGTAGTATTAGGTTTAGACTTCGTACTGACCGCCATCATGTTCGGTGCGAATTAATCTCTGTTTGTAAGGAAACGTTATGCGACAAACAATTAAATATGAATTTTGGGTCGGTTTATTTTTACTCCTTGGTATCGGCTCGCTTATCTTCTTAGGCTTAAAAGTGGCGAACGTGCAAGGtt > 1:837441/1‑251 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |