| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,452,727 | T→C | Y322H (TAC→CAC) | unknown → | ATPase required for both assembly of type IV secretion complex and secretion of T‑DNA complex, VirB11 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,452,727 | 0 | T | C | 100.0% | 250.8 / NA | 74 | Y322H (TAC→CAC) | unknown | ATPase required for both assembly of type IV secretion complex and secretion of T‑DNA complex, VirB11 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (36/38); total (36/38) | |||||||||||
ATCGTATTCTGCTTGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGATTTTATCAATGTGGTTTCTTCCGGGCATAACGGGTCGATTACCTCTTGTCATGCCGGTTCGGTTGCTGAAACCTGGGAACGGCTTATTTTAATGACGTTGCAAAACGACCAAGGGCGCACGCTTTCCTATGATGTAATTCACCGTTTATTACAACAAACGATAGATATTATCGTGCATGTTACCAACAGTCACGAATACGGCAGACATATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCCAAACTGAACTCTCTCAAGGTGGATTAACTATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGATTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTGGGGTAATTATCCGAAAATATGG > 1/1452488‑1452968 | aTCGTATTTTACTGGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGACTTTATCAATGTGGTTTCTTCCGGGCATAACGGGTCGATTACCTCTTGTCATGCCGGTTCGGTTGCTGAAACCTGGGAACGGCTTATTTTAATGACGTTGCAAAACGACCAAGGGCGCACGCTTTCCTATGATGTAATTCGCCGTTTATTACAACAAACGATAGATATTATTGTTCATGTTACCAACAGTCATGAACACGGCAGACa < 1:846655/250‑1 (MQ=255) 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ttattgttcATGTTACCAACAGTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTggg > 1:177848/9‑251 (MQ=255) attgttcATGTTACCAACAGTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGc > 1:207709/7‑234 (MQ=255) attgttcATGTTACCAACAGTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGc < 1:415719/228‑1 (MQ=255) tcATGTTACCAACAGTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTGGGGTAATTa < 1:9967/250‑1 (MQ=255) tGTTACCAACAGTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTGGGGTAATTATc > 1:161612/1‑250 (MQ=255) gTTACCAACAGTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTGGGGTAATTATCCg > 1:30557/1‑251 (MQ=255) tACCAACAGTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTAc < 1:270525/166‑1 (MQ=255) tACCAACAGTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTGGGGTAATTATCCGaa < 1:581010/251‑1 (MQ=255) ccAACAGTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTGGGGTAATTATCCGaaaa > 1:320157/1‑251 (MQ=255) aCAGTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTGGGGTAATTATCCGAAAatat > 1:361354/1‑251 (MQ=255) gTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGtaggtt < 1:314806/75‑6 (MQ=255) gTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTGGGGTAATTATCCGAAAat > 1:782245/1‑246 (MQ=255) gTCATGAACACGGCAGACACATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCTAAACTGAATTCGCTCAAGGTAGGTTAATGATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGCTTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTGGGGTAATTATCCGAAAATATgg > 1:642513/1‑250 (MQ=255) | ATCGTATTCTGCTTGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGATTTTATCAATGTGGTTTCTTCCGGGCATAACGGGTCGATTACCTCTTGTCATGCCGGTTCGGTTGCTGAAACCTGGGAACGGCTTATTTTAATGACGTTGCAAAACGACCAAGGGCGCACGCTTTCCTATGATGTAATTCACCGTTTATTACAACAAACGATAGATATTATCGTGCATGTTACCAACAGTCACGAATACGGCAGACATATGACGGAAATCTATTTTGATCCGCAAGCCAAACTGAACTCTCTCAAGGTGGATTAACTATGAAAAAAGCCAATATTGCATTATTCCTGTTTGTCACTTTGATTCCGACGTATTTTCTAAGTGGGCTTTTACTTCTACTGGCAAATAAAATTCGTTTAATCGAAGCATTTAAGCGCTACTACCCTACTCTAACGCTGGATGCCATTTGGGGTAATTATCCGAAAATATGG > 1/1452488‑1452968 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |