| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,452,420 | T→C | S219S (AGT→AGC) | unknown → | ATPase required for both assembly of type IV secretion complex and secretion of T‑DNA complex, VirB11 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,452,420 | 0 | T | C | 100.0% | 269.7 / NA | 80 | S219S (AGT→AGC) | unknown | ATPase required for both assembly of type IV secretion complex and secretion of T‑DNA complex, VirB11 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (56/24); total (56/24) | |||||||||||
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TTTGTCAGATGATGACTGGACACTACTGGAAATTTATCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTGGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTAGGCACCATCGAAGATACTCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAATTATTTCCACTTATTCTATCCAAGTGAAGCAAAAAACGGCGATTTAATCACAGCAGCCTCTTTGCTAAAATCCTGCTTACGGATGAAGCCTGATCGTATTCTGCTTGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGATTTTATCAATGTGGTTTCTTCCGGGCATAACGGGTCGATTACCTCTTGTCAT‑GCCGGTTCGGTTGCTGAAACCTGGGAACGGCTTATTTTAATGACGTTGCAAAACGACCAAGGGCGCACGCTTTCCTATGATG > 1/1452174‑1452664 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |