| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,452,357 | C→T | I198I (ATC→ATT) | unknown → | ATPase required for both assembly of type IV secretion complex and secretion of T‑DNA complex, VirB11 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,452,357 | 0 | C | T | 100.0% | 214.8 / NA | 63 | I198I (ATC→ATT) | unknown | ATPase required for both assembly of type IV secretion complex and secretion of T‑DNA complex, VirB11 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (45/18); total (45/18) | |||||||||||
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1:72987/3‑249 (MQ=255) aCCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCACGGCTGCCTCTTTGCTGAAATCTTGCCTACGAATGAAACCGGATCGTATTTTACTGGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGACTTTATCAATGTGGTTTCTTCCGGGCATAACGGGTCGATTACCTCTTGTCAT‑GCCGGTTCGGTTGCTGAAAc < 1:808223/251‑1 (MQ=255) ccATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCACGGCTGCCTCTTTGCTGAAATCTTGCCTACGAATGAAACCGGATCGTATTTTACTGGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGACTTTATCAATGTGGttt < 1:302294/195‑1 (MQ=255) ccATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCACGGCTGCCTCTTTGCTGAAATCTTGCCTACGAATGAAACCGGATCGTATTTTACTGGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGACTTTATCAATGTGGTttcttc > 1:672474/1‑199 (MQ=255) | GGATTATTACATCAACAACGGCTTTTTTAGTCGTGTTATCAAGACGGAAAATCGTTTGTCAGATGATGACTGGACACTACTGGAAATTTATCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTGGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTAGGCACCATCGAAGATACTCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAATTATTTCCACTTATTCTATCCAAGTGAAGCAAAAAACGGCGATTTAATCACAGCAGCCTCTTTGCTAAAATCCTGCTTACGGATGAAGCCTGATCGTATTCTGCTTGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGATTTTATCAATGTGGTTTCTTCCGGGCATAACGGGTCGATTACCTCTTGTCAT‑GCCGGTTCGGTTGCTGAAAC > 1/1452120‑1452602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |