| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,182,597 | A→C | L117V (TTG→GTG) | unknown ← | Phosphoglycolate phosphatase (EC 3.1.3.18) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,182,597 | 0 | A | C | 100.0% | 292.3 / NA | 86 | L117V (TTG→GTG) | unknown | Phosphoglycolate phosphatase (EC 3.1.3.18) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (53/33); total (53/33) | |||||||||||
ACCGTAGGTTAATCCCACCACCGGGCAGCCGGCATTGTGCGCGGCAATAATGTCATTGCGGGAATCGCCCACGAACAACACTTGTTTCGGATACAAACCGAATTTGCCACATAAATAGAACAACGGACCGGGATGCGGTTTGATTGCCGGTAAGGATTGACCGCCCAGCACTTCATCGAACAAGTCTTCAATGCCGAACGCCTTTAACACGGGACGGGTGTGTTGGGTCGGTTTATTGGTGACCAACGCCAAGCGGTAGCCTTTGGCTTTGAGTTTTTGCAGGGTGTCTTTGACGTTAGGAAATAAACGGCTACGGTTACAAATATTTTCGCCGTAAAACACATTAAAACGTTCTTTTAGCGTGGCAATCTGCGCTTCCGTCAAAGTTTTACCCGATTGCGCCGTCGCCCATTCCAAGGCGCGGGCGATTAAAATCTGCGCGCCATTGCCAATCCAGGTCAGCACCAACGCTTCCGGCGCTTGCGGCAAAT > 1/1182352‑1182842 | aCCGTAGGTTAATCCCACCACCGGGCAGCCGGCATTGTGCGCGGCAATAATGTCATTGCGGGAATCGCCCACGAACAACACTTGTTTCGGATACAAACCGAATTTGCCACATAAATAGAACAACGGACCGGGATGCGGTTTGATTGCCGGTAAGGATTGACCGCCCAGCACTTCATCGAACAAGTCTTCAATGCCGAACGCCTTTAACACGGGACGGGTGTGTTGGGTCGGTTTATTGGTGACCACCGCCa > 1:182193/1‑251 (MQ=255) 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tCCCACCACCGGGCAGCCGGCATTGTGCGCGGCAATAATGTCATTGCGGGAATCGCCCACGAACAACACTTGTTTCGGATACAAACCGAATTTGCCACATAAATAGAACAACGGACCGGGATGCGGTTTGATTGCCGGTAAGGATTGACCGCCCAGCACTTCATCGAACAAGTCTTCAATGCCGAACGCCTTTAACACGGGACGGGTGTGTTGGGTCGGTTTATTGGTGACCACCGCCAAGCGGTAGCCtt > 1:654147/1‑251 (MQ=255) accaccGGGCAGCCGGCATTGTGCGCGGCAATAATGTCATTGCGGGAATCGCCCACGAACAACACTTGTTTCGGATACAAACCGAATTTGCCACATAAATAGAACAACGGACCGGGATGCGGTTTGATTGCCGGTAAGGATTGACCGCCCAGCACTTCATCGAACAAGTCTTCAATGCCGAACGCCTTTAACACGGGACGGGTGTGTTGGGTCGGTTTATTGGTGACCACCGCCAAGCGGTAGCCTTTGGc < 1:82798/251‑1 (MQ=255) ccGGCATTGTGCGCGGCAATAATGTCATTGCGGGAATCGCCCACGAACAACACTTGTTTCGGATACAAACCGAATTTGCCACATAAATAGAACAACGGACCGGGATGCGGTTTGATTGCCGGTAAGGATTGACCGCCCAGCACTTCATCGAACAAGTCTTCAATGCCGAACGCCTTTAACACGGGACGGGTGTGTTGGGTCGGTTTATTGGTGACCACCGCCAAGCGGTAGCCTTTGGCTTTGAGTTTTTg > 1:346049/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |