| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,145,447 | T→C | T220T (ACT→ACC) | unknown → | Type I restriction‑modification system, restriction subunit R (EC 3.1.21.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,145,447 | 0 | T | C | 100.0% | 357.0 / NA | 103 | T220T (ACT→ACC) | unknown | Type I restriction‑modification system, restriction subunit R (EC 3.1.21.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (47/56); total (47/56) | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
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ttCTACTCCTAATCCGCCTATGGCAGCCCCGCTTTCAACTATTCCCGCGAAGAACATAAGCTCAACCTTGCCGAACTTTTAAACCCCCTTTCAGACGACCTGGAAAACACCGTCCTGAAAGACAACAACCTGTCCGTCATCAAACATACCCCCAAATTTATCAGCAACAAATCCCCCGACACGCCTACCAACCGAATCCTGACCTCGCTGCTGTGCCGCGACCGCCTCGCCTTTCTCCTGCAATACGGCtt < 1:174301/251‑1 (MQ=255) cTACTCCTCATCCGCCTATGGCAGCCCCGCTTTCAACTATTTCCGCGAAGAACATAAGCTCAACCTTGCCGAACTTTTAAACACCCTTTCAGACGACCTTGAAAACACCGTCCTGCAAGACAACAACCTGTCCGTCATCAAACATAACCCCGAATTTATCAGCAACAAATCCCCCGACACGCCTACCAACCGAATCCTGACCTCGCTGCTGTGCCGCGACCGCCTCGCCTTTCTCCTGCAATACGGCTTTg > 1:661391/1‑251 (MQ=255) cTACTCCTCATCCGCCTATGGCAGCCCCGCTTTCAACTATTTCCGCGAAGAACATAAGCTCAACCTTGCCGAACTTTTAAACACCCTTTCAGACGACCTTGAAAACACCGTCCTGCAAGACAACAACCTGTCCGTCATCAAACATAACCCCGAATTTATCAGCAACAAATCCCCCGACACGCCTACCAACCGAATCCTGACCTCGCTGCTGTGCCGCGACCGCCTCGCCTTTCTCCTGCAATACGGCTTTg > 1:414283/1‑251 (MQ=255) 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GCCCAATAACAAAGGCGGTATAGGCGCAGAACGCGAGCGGATGGCAAAGCGCGCGCAAAATCCCAAATTCCGCCGCTTTATCAACATCACCCAATTCATGATTTTTTCCAACAACATGGAATACGACGACGGCGCGACCGAGCCGGTGCAGGGCGCATTCTACTCCTCATCCGCCTATGGCAGCCCCGCTTTCAACTATTTCCGCGAAGAACATAAGCTCAACCTTGCCGAACTTTTAAACACTCTTTCAGACGACCTTGAAAACACCGTCCTGCAAGACAACAACCTGTCCGTCATCAAACATAACCCCGAATTTATCAGCAACAAATCCCCCGACACGCCTACCAACCGAATCCTGACCTCGCTGCTGTGCCGCGACCGCCTCGCCTTTCTCCTGCAATACGGCTTTGCATACGTCGAAACACAAAACGGCATAAAAAAACACATCATGCGCTATCCGCAGCTTTTCGCCGCCTACGCCACCG > 1/1145204‑1145688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |