| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,044,499 | C→T | H14Y (CAT→TAT) | unknown → | Nitrate/nitrite sensor protein NarQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,044,499 | 0 | C | T | 100.0% | 309.0 / NA | 90 | H14Y (CAT→TAT) | unknown | Nitrate/nitrite sensor protein NarQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (40/50); total (40/50) | |||||||||||
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> 1:41330/1‑167 (MQ=255) gTTTTCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTg > 1:256872/1‑251 (MQ=255) ttttCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATc > 1:579540/1‑82 (MQ=255) ttttCTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGAAATCGAACATGAACCACAAATGGTGGAAAGCAGCCTGCGCCAATATCGCGTg < 1:707017/250‑1 (MQ=255) cTACCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATTGTGATTATTATCTTTGTCGGCATCATCGGCGCATTAAGTCTGGCGCTGATGGCGGGCAATAAATCCTATGCGGAAGCCATTAACGTGTCCGGTTCATTGCGTATGCAAAGTTATCGCATACTTTATGaa < 1:338491/195‑1 (MQ=255) aCCAAGGCTTGTTATTTTGAAAATTAAACATTCCGTTTCCACCCGCATTGCCAACTATCTTATtg < 1:664125/65‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |