| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,031,191 | A→G | P273P (CCT→CCC) | unknown ← | 5'‑nucleotidase (EC 3.1.3.5); NAD pyrophosphatase, periplasmic (EC 3.6.1.22) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,031,191 | 0 | A | G | 100.0% | 290.3 / NA | 83 | P273P (CCT→CCC) | unknown | 5'‑nucleotidase (EC 3.1.3.5); NAD pyrophosphatase, periplasmic (EC 3.6.1.22) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (37/46); total (37/46) | |||||||||||
CTTTTCATCTTTTGTAAACTTTGAATTGCTTTTTGACGTTCTTCTCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGATCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAAGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTAAAGCATTCGCCATAATTTGGGCTGTTGCAATTTCATCATAAAATTTAACATC > 1/1030949‑1031418 | cTTTTCATCTTTTGTAAACTTTGAATTGCTTTTTGACGTTCTTCTCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTc < 1:346325/251‑1 (MQ=255) aTCTTTTGTAAACTTTGAATTGCTTTTTGACGTTCTTCTCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATac < 1:140002/251‑1 (MQ=255) aTCTTTTGTAAACTTTGAATTGCTTTTTGACGTTCTTCTCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATac < 1:273570/251‑1 (MQ=255) aTCTTTTGTAAACTTTGAATTGCTTTTTGACGTTCTTCTCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATac < 1:52087/251‑1 (MQ=255) gAATTGCTTTTTGACGTTCTTCTCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCa < 1:836787/230‑1 (MQ=255) gCTTTTTGACGTTCTTCTCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATac > 1:494827/1‑230 (MQ=255) gCTTTTTGACGTTCTTCTCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATac > 1:519436/1‑230 (MQ=255) aCGTTCTTCTCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCg < 1:269715/250‑1 (MQ=255) ttctCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTAc < 1:550831/251‑1 (MQ=255) tctcCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCTAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATac > 1:230482/1‑215 (MQ=255) ccACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCata > 1:322995/1‑251 (MQ=255) aCTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCatat > 1:33904/1‑208 (MQ=255) aCTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCAtata > 1:513875/1‑251 (MQ=255) aCTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCAtata > 1:280191/1‑251 (MQ=255) aaGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAAt < 1:853546/251‑1 (MQ=255) gTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAg > 1:357802/1‑251 (MQ=255) tCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAgtg < 1:561502/251‑1 (MQ=255) cAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATac < 1:336398/197‑1 (MQ=255) cAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAAt > 1:148319/1‑250 (MQ=255) ttACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCat > 1:206504/1‑190 (MQ=255) ttACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTAc > 1:503460/1‑229 (MQ=255) tCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGTTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAAc < 1:431566/251‑1 (MQ=255) gTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATacc > 1:105194/1‑184 (MQ=255) gTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATac < 1:884111/183‑1 (MQ=255) gTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACaataa > 1:249939/1‑251 (MQ=255) gTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACaataa > 1:751598/1‑251 (MQ=255) ttttAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAataata < 1:114456/251‑1 (MQ=255) ttAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATaatatc < 1:82873/251‑1 (MQ=255) ttAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATaatatc < 1:514369/251‑1 (MQ=255) tAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATaatatca < 1:811765/251‑1 (MQ=255) tatttGTGCTCATTAATACATGCGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAAt > 1:521177/1‑210 (MQ=255) atttGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCAtata > 1:700546/1‑164 (MQ=255) atttGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACtt < 1:898561/251‑1 (MQ=255) gtgCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTg > 1:12911/1‑251 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTc > 1:57313/1‑150 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATac > 1:652530/1‑156 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTc < 1:863458/186‑1 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAAt < 1:672017/200‑1 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAg > 1:538654/1‑202 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATaatatcaatat < 1:326145/233‑1 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATaatatc < 1:148958/228‑1 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATaatat < 1:305527/227‑1 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACtt < 1:897186/242‑1 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCaa > 1:499897/1‑251 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCaa > 1:284912/1‑251 (MQ=255) cATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCaa > 1:90405/1‑251 (MQ=255) ttAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATaccac > 1:637732/1‑157 (MQ=255) ttAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATaatatcaatat < 1:332607/231‑1 (MQ=255) aaTACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAAt > 1:882805/1‑196 (MQ=255) tACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTAc < 1:203256/185‑1 (MQ=255) tACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTa < 1:765079/251‑1 (MQ=255) tACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTa < 1:355041/251‑1 (MQ=255) cATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATac < 1:410551/148‑1 (MQ=255) cATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACtt > 1:488105/1‑234 (MQ=255) tgGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTc < 1:666020/250‑1 (MQ=255) gTTTTTCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATaatat > 1:169549/1‑211 (MQ=255) ttttCGGATTATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCTATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCAc < 1:451869/251‑1 (MQ=255) ttATGGAAGCGGTCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGatat > 1:898117/1‑122 (MQ=255) cggtCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAg > 1:837383/4‑167 (MQ=255) cggtCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTAATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGaaa < 1:203615/246‑1 (MQ=255) aTTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATGAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAg < 1:750218/236‑1 (MQ=255) cGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACAcc > 1:620500/1‑247 (MQ=255) ggAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATaccac < 1:84267/78‑1 (MQ=255) gAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAg < 1:641917/120‑1 (MQ=255) gAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATaatat < 1:389068/145‑1 (MQ=255) gAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTa < 1:511342/235‑1 (MQ=255) gAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATACTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGAt > 1:25203/1‑209 (MQ=255) cccAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTAAAGCATTCGCCATAATTTGGGc < 1:397481/250‑1 (MQ=255) aGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACaa < 1:559475/128‑1 (MQ=255) cTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAacac < 1:320996/210‑1 (MQ=255) ccATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTAAAGCATTCGCCATAATTTGGGCTGTTGCAAtt < 1:699975/251‑1 (MQ=255) ccATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTAAAGCATTCGCCATAATTTGGGCTGTTGCAAtt < 1:697763/251‑1 (MQ=255) ccATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTAAAGCATTCGCCATAATTTGGGCTGTTGCAAtt < 1:37517/251‑1 (MQ=255) cacaAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTAAAGCATTCGCCATAATTTGGGCTGTTGCAATTtcat > 1:96143/1‑251 (MQ=255) cAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTAc < 1:582652/81‑1 (MQ=255) ggTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTAAAGCATTCGCCATAATTTGGGCTGTTGCAAtt > 1:229692/1‑237 (MQ=255) cATTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATaa < 1:269377/174‑1 (MQ=255) aTTCGGGCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTAAAGTATTCGCCATAATTTGGGCTGTTGCAATTTCATCATAAAATTTAACATc > 1:619082/1‑249 (MQ=255) ggCTTTTAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAAtt < 1:446463/48‑1 (MQ=255) tttAAATTCTAAGGGATATTCATATTCCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTTCCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATaatatcaatat < 1:473703/104‑1 (MQ=255) tttAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCatat > 1:865207/1‑67 (MQ=255) tttAAATTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAAt > 1:853856/1‑71 (MQ=255) aTTCTAAGGGATATTCATATACCACCGGCGATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTAAAGCATTCGCCATAAt > 1:781796/1‑199 (MQ=255) | CTTTTCATCTTTTGTAAACTTTGAATTGCTTTTTGACGTTCTTCTCCACTAAGTTCCTGCCAATTACCGTCACTGTTTTTAACTTTTAATTTATTTGTGCTCATTAATACATGTGGAGTTTTTCGGATTATGGAAGCGATCCCATCTTTGCTGAATTTAACGCCTAAATCGCCCACTACGGCGGAATAAGCCCAAGCTTCCATCACAAAAACAGGTTCACCATTCGGGCTTTTAAATTCTAAAGGATATTCATATACCACCGGCAATTTCAATTCACGCAACTCGTCATTACCATATAAATAGTGTGAATCGCCGGTAACAATAATATCAATATCATTTACTTTTTGCGCAATTTCTATGTTCTTTTCACTGCCCGCATGGGAAAGTAAGATAATTTTGTTAACACCCTGTGCTTTTAAAGCATTCGCCATAATTTGGGCTGTTGCAATTTCATCATAAAATTTAACATC > 1/1030949‑1031418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |