| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 972,705 | A→G | S30S (AGT→AGC) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 972,705 | 0 | A | G | 100.0% | 284.8 / NA | 84 | S30S (AGT→AGC) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (48/36); total (48/36) | |||||||||||
TCGCTTGACCTTTAATAAGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAACTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGATTAGAGCATTTT > 1/972461‑972934 | tCGCTTGACCTTTAATAAGGTTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATg > 1:11421/1‑251 (MQ=255)tCGCTTGACCTTTAATAAGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATg < 1:860435/251‑1 (MQ=255) ttAATAAGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAg > 1:319279/1‑251 (MQ=255) taataaGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCACTAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAgg > 1:446734/1‑251 (MQ=255) taataaGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAgg > 1:314749/1‑251 (MQ=255) taataaGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAgg > 1:822142/1‑251 (MQ=255) aataaGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGt < 1:764550/251‑1 (MQ=255) aataaGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGACAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGt < 1:449529/251‑1 (MQ=255) aGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGc > 1:514702/1‑235 (MQ=255) tGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCgg < 1:543946/250‑1 (MQ=255) ttCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTc < 1:187303/251‑1 (MQ=255) gTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGc > 1:828840/1‑230 (MQ=255) gTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGAt > 1:37871/1‑251 (MQ=255) cAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGAt > 1:231133/1‑247 (MQ=255) gAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGc > 1:286413/1‑202 (MQ=255) gAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATa > 1:167495/1‑251 (MQ=255) gAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATa > 1:893862/1‑251 (MQ=255) gAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATa > 1:686532/1‑251 (MQ=255) aaGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTc > 1:413994/1‑205 (MQ=255) aaGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCgtt > 1:561567/1‑251 (MQ=255) aGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCgttg > 1:53761/1‑251 (MQ=255) gATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATg > 1:202992/1‑251 (MQ=255) tAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAAt < 1:490475/251‑1 (MQ=255) gATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATg > 1:772198/1‑250 (MQ=255) aTAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTg > 1:461631/1‑167 (MQ=255) aTAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGc < 1:406148/250‑1 (MQ=255) cGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTa < 1:422518/243‑1 (MQ=255) cGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGat > 1:39529/1‑251 (MQ=255) cccTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAAt < 1:106534/239‑1 (MQ=255) cccTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGataa > 1:857754/1‑251 (MQ=255) tAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAatat < 1:565024/251‑1 (MQ=255) tAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAatat < 1:508514/251‑1 (MQ=255) atatCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCt < 1:50083/251‑1 (MQ=255) cTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCt < 1:422054/247‑1 (MQ=255) cTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATg < 1:534033/251‑1 (MQ=255) tAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAAtt > 1:72406/1‑251 (MQ=255) gCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAAt < 1:848514/218‑1 (MQ=255) tGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTc < 1:174822/250‑1 (MQ=255) gTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCt < 1:640360/223‑1 (MQ=255) cccTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCATAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTtaat > 1:444956/1‑251 (MQ=255) tctatctaAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATaaa < 1:646505/251‑1 (MQ=255) ctatctaAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAAc < 1:629132/251‑1 (MQ=255) atctaAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGAt > 1:409992/1‑145 (MQ=255) atctaAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTa < 1:53919/195‑1 (MQ=255) atctaAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGc < 1:168737/198‑1 (MQ=255) atctaAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCt > 1:221205/1‑210 (MQ=255) aTCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACa > 1:341208/1‑251 (MQ=255) tCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTAcc > 1:547024/1‑179 (MQ=255) tCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTtaata < 1:510887/239‑1 (MQ=255) cATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCgt > 1:864382/1‑168 (MQ=255) cATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAAt > 1:781280/1‑185 (MQ=255) cATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCt > 1:395594/1‑202 (MQ=255) tatatCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAAc < 1:697876/239‑1 (MQ=255) tatatCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTc > 1:611268/1‑250 (MQ=255) tatCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCgt > 1:485720/1‑164 (MQ=255) atCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACAt < 1:9578/245‑1 (MQ=255) aGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCgt > 1:172745/1‑157 (MQ=255) gTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAAc > 1:339304/1‑229 (MQ=255) ccACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTa < 1:816379/171‑1 (MQ=255) ccACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCt > 1:246444/1‑186 (MQ=255) actgaTCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGa > 1:267585/5‑251 (MQ=255) aCTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGa > 1:73096/1‑251 (MQ=255) tATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAAt < 1:366088/251‑1 (MQ=255) aTCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATc < 1:204914/179‑1 (MQ=255) aTAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTAccc > 1:697901/1‑236 (MQ=255) cAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTtaata < 1:26933/202‑1 (MQ=255) aaaTGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTAcc > 1:59361/1‑138 (MQ=255) aTGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGTACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTaa > 1:250189/1‑251 (MQ=255) gTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATc > 1:599331/1‑229 (MQ=255) gCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAAt > 1:341739/1‑221 (MQ=255) gCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGa > 1:380631/1‑251 (MQ=255) ctGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGt < 1:191534/153‑1 (MQ=255) gTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCt < 1:882857/146‑1 (MQ=255) gTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAAc < 1:228946/185‑1 (MQ=255) gTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTAc < 1:275427/192‑1 (MQ=255) cacaATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGAtt < 1:494114/251‑1 (MQ=255) aaTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGATTaga > 1:652063/1‑251 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTtaata > 1:857901/1‑174 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTAccc > 1:700745/1‑200 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAAt < 1:68134/208‑1 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGAtt < 1:254352/247‑1 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGATTagag > 1:23627/1‑251 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGATTagag > 1:399383/1‑251 (MQ=255) gcggcACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGATTAGAGCAtttt < 1:417583/250‑1 (MQ=255) | TCGCTTGACCTTTAATAAGGGTGCTTTCGCCATTAATCGGTCTCAATACGGAATAAAGCGAATGGTTGACTAAGTTTACCTGTTGATTAAACGATAACGCCCTAATATCTTCATAAATCTGCGGTGCAATCGGTTCAAACCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAACTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGATTAGAGCATTTT > 1/972461‑972934 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |