| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 876,635 | G→A | C284Y (TGT→TAT) | unknown → | L‑threonate/D‑erythronate, proton symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 876,635 | 0 | G | A | 100.0% | 327.8 / NA | 97 | C284Y (TGT→TAT) | unknown | L‑threonate/D‑erythronate, proton symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (41/56); total (41/56) | |||||||||||
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tttttAGCATGGTCGGAAGCTCGCCGTTCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACa < 1:605965/251‑1 (MQ=255) ttttAGCATGGTCGGAAGCTCGCCGTTCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACAt < 1:311907/251‑1 (MQ=255) ggTCGGAAGCTCGCCGTTCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCa > 1:301204/1‑199 (MQ=255) 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tCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCAttatta < 1:773826/251‑1 (MQ=255) tCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAACTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCAttatta < 1:425008/251‑1 (MQ=255) cGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAg > 1:419635/1‑70 (MQ=255) cGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCAttattat > 1:720120/1‑250 (MQ=255) ccTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTAc > 1:586021/1‑220 (MQ=255) ccTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCAttattatgc < 1:824197/251‑4 (MQ=255) ttATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCATTATTAtgcg > 1:352628/1‑250 (MQ=255) ttATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCATTATTATgcgc < 1:129171/251‑1 (MQ=255) ggctgTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCATTATTATGCGCAGCACAAg > 1:18209/1‑251 (MQ=255) ctgTTTGTGTTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATcc < 1:184193/185‑1 (MQ=255) gtgtTTCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAgg < 1:585890/109‑1 (MQ=255) 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tttCTTCTTATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCATTATTATGCGCAGCACAAGGTTCTGCGAc < 1:26389/250‑1 (MQ=255) cttcttATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCATTATTATGCGCAGCACAAGGTTCTGCGACAGTg > 1:633056/1‑251 (MQ=255) cttcttATGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCATTATTATGCGCAGCACAAGGTTCTGCGACAGTg > 1:718039/1‑251 (MQ=255) | CATTTATTCATATACCAACTTCAGCAGATTTAATTCAATATCAAAAACAGCTATCTCATGATGCTTCCGGATTACCTAAATTCGGCACGGTTTTAAGCATGATTGTGTTTCCGCTCGTATTAATTATGTTGGGCACGATCACAGCAGTAACTTTACCAAAAGAACATATAATCCGTGAAATTTTTAGCATGGTCGGAAGCTCGCCGTTCGCCTTATTGCTGGCTGTTTGTGTTTCTTCTTGTGTATTAGGCTTACGTCGTGGCTGGAATAAAGAAAAGTTAGAAGAAATTCTTAACTCATCTTTGGCACCAATTGCCGGGATTATCTTAATTACAGGTGCCGGCGGGATGTTTGGTAAAGTTTTAGATGCAAGTGGTGTAGGAAAGGCATTGGCTGAGGTACTATCCGGCACCGGATTACATGTTCTTACATTAGGTTTTGTGCTAGCAGCATTATTACGCGCAGCACAAGGTTCTGCGACAGTG > 1/876395‑876879 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |